36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3518 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5436  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0949322  normal  0.0915809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4848  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3518  Type III secretion system HrpE/YscL  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253777  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  92.82 
 
 		 209 aa  383  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  92.82 
 
 		 209 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  86.6 
 
 		 209 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  30.1 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  28.21 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  28.28 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  25.5 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  26.67 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0423  type III secretion system protein HrpB  32.83 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1899  type III secretion system protein HrpB  32.83 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1991  type III secretion system protein HrpB  32.83 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  24.5 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5852  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  27.06 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  25.5 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5635  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  29.81 
 
 		 335 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0813541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5938  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  30.92 
 
 		 289 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3124  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein like  30.3 
 
 		 318 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0778311  hitchhiker  0.00270751 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0869  type III secretion system protein HrpB  28.99 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371286  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  29.51 
 
 		 256 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2287  type III secretion system protein HrpB  28.95 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0183918  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1949  type III secretion system protein HrpB  28.95 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0685  type III secretion system protein HrpB  28.95 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129872  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1636  type III secretion system protein HrpB  28.95 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0628  type III secretion system protein HrpB  28.95 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2204  type III secretion system protein HrpB  28.95 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  21.51 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.17 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  23.57 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0745  type III secretion system protein HrpB  27.81 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694748  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5214  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.54 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  23.25 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.83 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  29.34 
 
 		 209 aa  42  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>