More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3453 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  99.38 
 
 		 320 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  100 
 
 		 320 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  100 
 
 		 320 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  98.43 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  96.86 
 
 		 324 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  96.86 
 
 		 324 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  96.23 
 
 		 324 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  87.74 
 
 		 318 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  87.74 
 
 		 318 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  87.74 
 
 		 318 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  87.74 
 
 		 318 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  87.11 
 
 		 318 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  87.11 
 
 		 318 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  86.16 
 
 		 318 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  79.23 
 
 		 321 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  78.91 
 
 		 321 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  76.04 
 
 		 321 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  55.84 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  55.84 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  57.14 
 
 		 333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  55.48 
 
 		 333 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  55.66 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  56.91 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  54.19 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  53.67 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  55.41 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  53.99 
 
 		 329 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  52.73 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  51.28 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  52.92 
 
 		 326 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  51.44 
 
 		 328 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 350 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  46.71 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  46.69 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  47.81 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 342 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 333 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  46.2 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  46.2 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  45.34 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.3 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  47.4 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  46.62 
 
 		 337 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  43.71 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 347 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  44.27 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  42.41 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  45.77 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  47.08 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  46.95 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  41.75 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 315 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  43.81 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  43.62 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  43.11 
 
 		 346 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  41.96 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  43.04 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  40.81 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>