More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3448 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  100 
 
 
286 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  100 
 
 
286 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  99.3 
 
 
286 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  89.16 
 
 
286 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  86.17 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  77.66 
 
 
286 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  85.46 
 
 
286 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  64.68 
 
 
275 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  65.43 
 
 
275 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  69.14 
 
 
279 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  65.91 
 
 
286 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  61.9 
 
 
276 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  62.27 
 
 
276 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  61.9 
 
 
276 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  64.36 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  62.27 
 
 
276 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  59.19 
 
 
278 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  58.55 
 
 
278 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  59.34 
 
 
278 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  57.79 
 
 
276 aa  271  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  61.4 
 
 
274 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  58.62 
 
 
274 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  60.66 
 
 
274 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  53.09 
 
 
275 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  54.92 
 
 
278 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  53.79 
 
 
267 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  53.65 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  50.91 
 
 
274 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  52.21 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  50.38 
 
 
271 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  49.46 
 
 
275 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  48.73 
 
 
274 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  49.42 
 
 
271 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  52.92 
 
 
276 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  47.73 
 
 
287 aa  225  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  51.27 
 
 
280 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  49.81 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  53.18 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  53.28 
 
 
279 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  54.05 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  50.97 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  52 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  46.95 
 
 
272 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  49.06 
 
 
276 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  48.86 
 
 
276 aa  205  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  52.9 
 
 
279 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  46.74 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  42.03 
 
 
278 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  39.58 
 
 
271 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.7 
 
 
284 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  28.24 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  38.7 
 
 
276 aa  135  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.32 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.15 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  37.68 
 
 
268 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.45 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  34.31 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  42.61 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  27.17 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.94 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  38.79 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.33 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  34.12 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.7 
 
 
253 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  34.78 
 
 
258 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  34.44 
 
 
277 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  39.15 
 
 
273 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  32.25 
 
 
274 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  34.21 
 
 
282 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  34.81 
 
 
267 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  33.61 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  34.09 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  36.71 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  33.2 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  28.8 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  35.24 
 
 
255 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  32.64 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  31.56 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  30.26 
 
 
269 aa  92  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  37.14 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  34.14 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.19 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.1 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  34 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  35.77 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  34 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  34 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  36.9 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.73 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  37.14 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  34.88 
 
 
259 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  35.66 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  33.92 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  36.07 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.2 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.08 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  32.09 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  34.35 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  32.64 
 
 
252 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>