66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3151 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  99.36 
 
 		 312 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  26.18 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  31.32 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  25.47 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  27.84 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  28.33 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  30.82 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  23.86 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  23.95 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  25.88 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  22.26 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  26.19 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  24.79 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  26.59 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  24.79 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  24.79 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  24.79 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  25.86 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  27.36 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  27.94 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  25 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  26.07 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  24.36 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  24.55 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  24.36 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  25.21 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  25.21 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  24.36 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  21.4 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  24.8 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  24.8 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  24.8 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  24.8 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  26.09 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.27 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.32 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.32 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.32 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  24.47 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.32 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  26.56 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  24.05 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  30.32 
 
 		 196 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  21.4 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  22.79 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  25.48 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  25.48 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  26.34 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  26.17 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  22.92 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  26.56 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  30 
 
 		 440 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  23.03 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  21.75 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  22.12 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  21.33 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  21.33 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  23.83 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  23.05 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  25.52 
 
 		 563 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  20.88 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15830  hypothetical protein  32.47 
 
 		 165 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0074836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  20.88 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  23.19 
 
 		 497 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>