51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3075 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5292  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3075  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4976  hypothetical protein  98.42 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0356  hypothetical protein  92.83 
 
 
287 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605747  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4653  hypothetical protein  86.45 
 
 
263 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000611721  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5181  hypothetical protein  86.64 
 
 
247 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3431  hypothetical protein  78.88 
 
 
290 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0788325  normal  0.331854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6605  hypothetical protein  77.49 
 
 
267 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202488  normal  0.0603228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4641  hypothetical protein  76.39 
 
 
268 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435514  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2586  hypothetical protein  75.11 
 
 
270 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195535  normal  0.261954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4874  hypothetical protein  72.81 
 
 
242 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2567  hypothetical protein  75 
 
 
250 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0806  hypothetical protein  71.98 
 
 
256 aa  357  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2935  hypothetical protein  73.8 
 
 
247 aa  354  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2839  hypothetical protein  72.81 
 
 
246 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0550  hypothetical protein  71.18 
 
 
253 aa  350  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2433  hypothetical protein  71.49 
 
 
246 aa  347  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2122  hypothetical protein  70.61 
 
 
260 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1573  hypothetical protein  70.61 
 
 
260 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0615  hypothetical protein  70.61 
 
 
260 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0708  hypothetical protein  70.61 
 
 
260 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2028  hypothetical protein  70.61 
 
 
260 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2210  hypothetical protein  70.61 
 
 
252 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3752  hypothetical protein  68.24 
 
 
250 aa  338  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.373464  normal  0.298029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1043  hypothetical protein  70.61 
 
 
234 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0477  hypothetical protein  66.52 
 
 
240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1005  hypothetical protein  66.67 
 
 
235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938638  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2936  hypothetical protein  64.94 
 
 
237 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58625  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0369  hypothetical protein  67.38 
 
 
241 aa  320  9.000000000000001e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.535424  normal  0.368582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4926  hypothetical protein  64.89 
 
 
240 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5118  hypothetical protein  67.98 
 
 
248 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5451  hypothetical protein  64.62 
 
 
215 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0109  hypothetical protein  64.22 
 
 
237 aa  291  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4934  hypothetical protein  55.33 
 
 
252 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3796  hypothetical protein  63.39 
 
 
327 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0260876  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4049  hypothetical protein  61.5 
 
 
228 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460328  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6380  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  49.57 
 
 
237 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1574  hypothetical protein  48.93 
 
 
237 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0564  Protein of unknown function DUF2086  50.44 
 
 
231 aa  254  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1062  hypothetical protein  51.32 
 
 
233 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0319  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  48.07 
 
 
239 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4448  hypothetical protein  51.34 
 
 
232 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5613  hypothetical protein  48.5 
 
 
250 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195898  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0185  hypothetical protein  46.98 
 
 
243 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06480  hypothetical protein  45.23 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3764  hypothetical protein  45.61 
 
 
234 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4932  hypothetical protein  43.81 
 
 
225 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4735  hypothetical protein  47.23 
 
 
238 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12256  hypothetical protein  53.29 
 
 
233 aa  182  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290448  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3794  hypothetical protein  39.42 
 
 
237 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0438272  normal  0.676027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0315  hypothetical protein  44.85 
 
 
142 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.362131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>