50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3026 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5667  citrate carrier protein  85.24 
 
 
454 aa  777    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5219  citrate carrier protein  98.46 
 
 
454 aa  882    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.374484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4928  citrate carrier protein  99.78 
 
 
454 aa  893    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509755  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3390  citrate carrier protein  94.27 
 
 
454 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301093  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0308  citrate carrier protein  95.81 
 
 
454 aa  864    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5340  citrate carrier protein  100 
 
 
469 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.522817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3026  citrate carrier protein  100 
 
 
469 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4690  citrate carrier protein  97.37 
 
 
456 aa  874    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4998  citrate symporter citrate carrier protein  73.03 
 
 
448 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5090  citrate carrier protein  66.67 
 
 
443 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59557  decreased coverage  0.00122276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3730  citrate carrier protein  58.88 
 
 
451 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3377  citrate carrier protein  56.08 
 
 
454 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2023  Citrate carrier protein  56.58 
 
 
452 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1750  Citrate carrier protein  56.58 
 
 
456 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0792  Na+/citrate symporter protein  55.74 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.69813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2222  Citrate carrier protein  55.23 
 
 
455 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.82686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2324  Citrate carrier protein  56.25 
 
 
455 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4129  citrate carrier protein  57.99 
 
 
454 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0616  citrate cation symporter family  39.18 
 
 
448 aa  352  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0578  citrate cation symporter family protein  39.18 
 
 
448 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0547  citrate cation symporter family protein  39.18 
 
 
448 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000864872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0634  citrate cation symporter family  38.95 
 
 
448 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0491  Na+/malate symporter  38.41 
 
 
448 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0408466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4723  citrate cation symporter family  38.95 
 
 
448 aa  349  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.470535  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0489  Na+/malate symporter  38.95 
 
 
448 aa  349  7e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0641  citrate cation symporter family protein  39.35 
 
 
442 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0492  citrate carrier protein  38.86 
 
 
448 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0498  citrate carrier protein  37.42 
 
 
448 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1920  CCS family citrate carrier protein  41.04 
 
 
445 aa  319  7e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296247  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6958  citrate carrier protein  41.65 
 
 
440 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4099  Citrate carrier protein  39.05 
 
 
483 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3908  Citrate carrier protein  39.06 
 
 
446 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0043  Citrate carrier protein  37.1 
 
 
447 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0048  Citrate carrier protein  37.35 
 
 
447 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.844506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2099  citrate carrier protein  38.02 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.474742  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1297  Citrate carrier protein  37.86 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.877313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0701  citrate carrier protein  34.53 
 
 
437 aa  219  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2700  CCS family citrate carrier protein  34.92 
 
 
430 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.545794  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0064  citrate-sodium symporter  28.83 
 
 
446 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0062  citrate-sodium symporter  28.83 
 
 
446 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.608225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0062  citrate-sodium symporter  28.83 
 
 
446 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.557589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0061  citrate-sodium symporter  28.83 
 
 
446 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215839  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0063  citrate-sodium symporter  28.9 
 
 
446 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1006  Na+/malate symporter  31.18 
 
 
420 aa  169  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2789  citrate carrier protein  30.56 
 
 
427 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00204722  normal  0.85346 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1168  citrate/sodium symporter  29.34 
 
 
446 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0322  citrate/sodium symporter  28.71 
 
 
448 aa  140  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2357  citrate carrier protein  37.14 
 
 
301 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1118  citrate carrier protein  29.9 
 
 
412 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0978  malate transporter  27.89 
 
 
385 aa  123  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.220084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>