More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3025 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.38 
 
 		 631 aa  1184    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  98.1 
 
 		 627 aa  1230    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.58 
 
 		 623 aa  946    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.59 
 
 		 627 aa  1116    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.38 
 
 		 627 aa  1177    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 634 aa  1267    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.22 
 
 		 638 aa  1188    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 634 aa  1267    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 628 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  40.39 
 
 		 616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  38.59 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 672 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  39.55 
 
 		 659 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  39.06 
 
 		 626 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  40.85 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  40.03 
 
 		 670 aa  364  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  40.51 
 
 		 621 aa  363  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  41.02 
 
 		 621 aa  357  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 637 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  39.55 
 
 		 630 aa  355  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  36.2 
 
 		 635 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  36.75 
 
 		 618 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  35.95 
 
 		 643 aa  349  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  38.44 
 
 		 666 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 668 aa  346  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  37.17 
 
 		 666 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  36.35 
 
 		 633 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  40.03 
 
 		 600 aa  343  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 634 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 635 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.48 
 
 		 677 aa  340  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.37 
 
 		 665 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.67 
 
 		 634 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.55 
 
 		 677 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 634 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 683 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 634 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.55 
 
 		 677 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  37.3 
 
 		 635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 669 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 669 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  37.78 
 
 		 669 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  38.68 
 
 		 643 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.84 
 
 		 643 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  38.84 
 
 		 643 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  37.93 
 
 		 669 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.83 
 
 		 677 aa  333  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 635 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  38.59 
 
 		 615 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  37.42 
 
 		 590 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  40.34 
 
 		 611 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  38.29 
 
 		 638 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  38.19 
 
 		 597 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  38.33 
 
 		 600 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  38.18 
 
 		 668 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 672 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 677 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 606 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  36.59 
 
 		 667 aa  316  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  39.17 
 
 		 645 aa  316  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  32.72 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 591 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 622 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 618 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  35.88 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  36.69 
 
 		 617 aa  300  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 585 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  37.56 
 
 		 622 aa  299  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 652 aa  298  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 604 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  34.65 
 
 		 620 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  35.78 
 
 		 604 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  36.59 
 
 		 592 aa  293  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.25 
 
 		 597 aa  293  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  35.71 
 
 		 604 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  35.62 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  35.3 
 
 		 602 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 621 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 586 aa  290  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  35.51 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 604 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 604 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  30.58 
 
 		 601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  34.67 
 
 		 622 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  34.06 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 585 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  35.13 
 
 		 604 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  34.16 
 
 		 612 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  33.28 
 
 		 603 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 602 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 621 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  33.66 
 
 		 600 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  33.9 
 
 		 623 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  35.5 
 
 		 615 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 603 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 585 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  37.33 
 
 		 591 aa  264  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 585 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  33 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  28.95 
 
 		 613 aa  260  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>