47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3009 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4913  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5357  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3009  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3368  lysine exporter protein LysE/YggA  87.82 
 
 
196 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0288  lysine exporter protein LysE/YggA  88.83 
 
 
196 aa  313  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4707  lysine exporter protein LysE/YggA  87.82 
 
 
196 aa  303  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  normal  0.57168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5087  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.21 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7458  hypothetical protein  26.63 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0616  lysine exporter protein LysE/YggA  29.01 
 
 
210 aa  52  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  33.08 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  33.08 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3570  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.86 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.71 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  33.08 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  33.82 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  33.82 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0427  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.23 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  32.86 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1198  lysine exporter protein LysE/YggA  27.18 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.21 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  31.91 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  31.91 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  31.91 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  31.91 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  31.91 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  31.91 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1054  lysine exporter protein LysE/YggA  33.07 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  27.97 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.32 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  26.19 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  31.91 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  27.97 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  27.87 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  26.19 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  26.19 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2113  hypothetical protein  44.26 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.8 
 
 
204 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 
212 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 
212 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 
212 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  30.08 
 
 
212 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1754  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.08 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  31.43 
 
 
223 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1477  lysine exporter protein LysE/YggA  27.66 
 
 
223 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0681758  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  26.19 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.63 
 
 
209 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>