237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3001 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  100 
 
 
285 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  100 
 
 
285 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  97.89 
 
 
285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  90.18 
 
 
285 aa  534  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  65.25 
 
 
283 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  65.25 
 
 
283 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  58.04 
 
 
292 aa  331  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  57.04 
 
 
281 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  52.16 
 
 
309 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  51.22 
 
 
277 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  68.75 
 
 
159 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  38.99 
 
 
266 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 
269 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  37.32 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  37.33 
 
 
267 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  38.13 
 
 
276 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
264 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  36.79 
 
 
255 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  36.79 
 
 
255 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  36.43 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  36.62 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  35.79 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  36.07 
 
 
255 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  36.17 
 
 
255 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
255 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  35.97 
 
 
255 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  35.67 
 
 
271 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  36.82 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  34.02 
 
 
280 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  36.59 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  35.97 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  35.54 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  35 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  34.42 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 
276 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  32.65 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  33.47 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  33.1 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  35.1 
 
 
294 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  35.37 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  35.62 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  26.82 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  29.2 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  28 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  28 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  23.26 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.71 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  27.52 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  25.35 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  27.37 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  27.37 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.99 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  26.04 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  29.45 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  26.47 
 
 
272 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.83 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  27.74 
 
 
272 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.05 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
252 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
274 aa  52.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  35.4 
 
 
211 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.29 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.79 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  27.91 
 
 
389 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  32.74 
 
 
541 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
252 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
269 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>