22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3000 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5366  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4904  GCN5-related N-acetyltransferase  98.39 
 
 
186 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161887  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0265  GCN5-related N-acetyltransferase  89.73 
 
 
186 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2796  acetyltransferase  64.67 
 
 
179 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32860  hypothetical protein  63.47 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13633  hitchhiker  0.000180754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3517  GCN5-related N-acetyltransferase  53.29 
 
 
188 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 
177 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2041  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0503175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00330  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2575  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000740993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  35.71 
 
 
477 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  40.85 
 
 
478 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  39.44 
 
 
465 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  39.44 
 
 
465 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  36.84 
 
 
238 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  34.25 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  36.62 
 
 
451 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1097  acetyltransferase  25 
 
 
284 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.807125  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6597  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
171 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  32.88 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>