254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2902 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2902  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 
148 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4015  carboxymuconolactone decarboxylase  78.08 
 
 
151 aa  215  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0483947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  71.81 
 
 
149 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  54.29 
 
 
151 aa  157  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  54.29 
 
 
151 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  53.1 
 
 
151 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  50.71 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  50.71 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.41 
 
 
151 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  51.02 
 
 
149 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.71 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0025  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.94 
 
 
153 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0126747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.14 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.57 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.38 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.71 
 
 
146 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
163 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 
143 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  44.29 
 
 
153 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.36 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.24 
 
 
155 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.29 
 
 
145 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.57 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  42.86 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 
152 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
162 aa  114  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.17 
 
 
145 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  43.97 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  43.97 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  41.84 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  43.97 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  43.97 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.57 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  43.97 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.84 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
157 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  35.42 
 
 
150 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
145 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  43.26 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.62 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.97 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.46 
 
 
143 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.86 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.13 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.26 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.61 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  43.57 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  38.69 
 
 
145 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
153 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.93 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  38.69 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.86 
 
 
146 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
145 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
143 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
143 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.43 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.43 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.43 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.43 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.43 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.85 
 
 
283 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.64 
 
 
151 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.43 
 
 
150 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  36.88 
 
 
158 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
145 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  43.07 
 
 
152 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.16 
 
 
149 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
145 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.86 
 
 
145 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
145 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  43.18 
 
 
157 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
150 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.86 
 
 
145 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
163 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  44.72 
 
 
155 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  41.86 
 
 
151 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 
147 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.18 
 
 
156 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.6 
 
 
154 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  42.42 
 
 
157 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  39.44 
 
 
158 aa  97.1  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  34.97 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  34.97 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>