152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2634 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  94.67 
 
 
366 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  95.27 
 
 
366 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  95.27 
 
 
366 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  99.7 
 
 
366 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  98.82 
 
 
366 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  93.49 
 
 
366 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  77.22 
 
 
366 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  77.22 
 
 
366 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  77.22 
 
 
366 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  77.22 
 
 
366 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  77.22 
 
 
366 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  77.22 
 
 
366 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  77.22 
 
 
366 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  76.63 
 
 
366 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  73.67 
 
 
364 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  56.61 
 
 
363 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  50.15 
 
 
363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  47.65 
 
 
354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  34.59 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  34.87 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  34.87 
 
 
356 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  34.54 
 
 
356 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  33.88 
 
 
356 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  35.71 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.82 
 
 
359 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.43 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  33.08 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  36 
 
 
348 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  35.21 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  35.86 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  28.98 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.84 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.23 
 
 
370 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  29.82 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  29.82 
 
 
331 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  29.82 
 
 
331 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  32.41 
 
 
357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.57 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  32.63 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  29.92 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  33.86 
 
 
337 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.32 
 
 
349 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.56 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  30.35 
 
 
331 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.97 
 
 
385 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.59 
 
 
332 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.57 
 
 
332 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  27.51 
 
 
338 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  33.46 
 
 
340 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  33.46 
 
 
340 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  33.46 
 
 
340 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  33.46 
 
 
340 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  30.74 
 
 
336 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.73 
 
 
337 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  33.46 
 
 
348 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  30 
 
 
329 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  33.46 
 
 
340 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  34.16 
 
 
340 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  27.99 
 
 
337 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  27.46 
 
 
335 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  28.75 
 
 
329 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  29.17 
 
 
357 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  31.64 
 
 
366 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  31.94 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  31.94 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  31.06 
 
 
388 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  31.94 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  31.94 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  29.84 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  29.84 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  29.84 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  31.94 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  31.94 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  31.94 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  29.69 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.9 
 
 
351 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.47 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.47 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  30.24 
 
 
349 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  28.63 
 
 
353 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  26.28 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  28.69 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  24.24 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  25.96 
 
 
332 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  28 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  27 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  25.42 
 
 
335 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  25.42 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  27.55 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  25.99 
 
 
308 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  26.26 
 
 
341 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  26.26 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  33.06 
 
 
427 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  26.26 
 
 
341 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  28.35 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  24.56 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  31.98 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  28.35 
 
 
338 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  25.08 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>