More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2507 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.42 
 
 		 803 aa  1257    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  94.49 
 
 		 817 aa  1486    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 804 aa  1618    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  89.66 
 
 		 802 aa  1400    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  57.63 
 
 		 811 aa  839    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  89.54 
 
 		 802 aa  1399    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  89.36 
 
 		 806 aa  1399    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.77 
 
 		 812 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  89.61 
 
 		 787 aa  1375    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  97.51 
 
 		 804 aa  1527    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  89.54 
 
 		 802 aa  1399    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 764 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  80.85 
 
 		 800 aa  1275    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  89.48 
 
 		 787 aa  1337    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.49 
 
 		 823 aa  841    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  96.75 
 
 		 800 aa  1501    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.22 
 
 		 823 aa  824    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  81.47 
 
 		 800 aa  1283    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 804 aa  1618    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  89.66 
 
 		 802 aa  1400    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  89.54 
 
 		 802 aa  1399    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  96.77 
 
 		 804 aa  1509    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 770 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 804 aa  1618    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.89 
 
 		 827 aa  635  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 765 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.41 
 
 		 781 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  46.59 
 
 		 774 aa  605  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 765 aa  594  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 772 aa  591  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 776 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 718 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 775 aa  588  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 780 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 764 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 762 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 762 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  44.59 
 
 		 705 aa  528  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 744 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 708 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 710 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 736 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  36.17 
 
 		 734 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 734 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 736 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  34.43 
 
 		 710 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 725 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  35.47 
 
 		 712 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 816 aa  333  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 736 aa  268  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 733 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.01 
 
 		 754 aa  257  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 731 aa  251  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 779 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 740 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 733 aa  239  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 749 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  30.58 
 
 		 767 aa  235  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 760 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 741 aa  231  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 779 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 753 aa  226  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 756 aa  225  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 759 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 738 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 752 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 737 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 753 aa  221  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  27 
 
 		 759 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  28.18 
 
 		 774 aa  219  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.95 
 
 		 748 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  28.18 
 
 		 774 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 746 aa  218  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 756 aa  218  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 845 aa  217  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 757 aa  216  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.25 
 
 		 714 aa  214  7e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 756 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 756 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 771 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 756 aa  210  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 752 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 756 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 748 aa  207  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 753 aa  207  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 769 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 756 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 814 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 799 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 713 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 762 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 763 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  31.07 
 
 		 799 aa  193  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  30.95 
 
 		 742 aa  193  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 753 aa  193  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 799 aa  193  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 755 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 784 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>