More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2500 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  93.72 
 
 		 382 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  93.72 
 
 		 382 aa  701    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  93.72 
 
 		 382 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  93.72 
 
 		 382 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  93.46 
 
 		 382 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  98.95 
 
 		 382 aa  755    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 382 aa  760    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  93.72 
 
 		 382 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  98.43 
 
 		 382 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0048  rod shape-determining protein RodA  87.7 
 
 		 382 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  93.72 
 
 		 382 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  87.43 
 
 		 382 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 382 aa  760    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  97.38 
 
 		 382 aa  747    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 382 aa  760    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  87.43 
 
 		 382 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  93.72 
 
 		 382 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  97.38 
 
 		 382 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  71.24 
 
 		 380 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3363  rod shape-determining protein RodA  72.18 
 
 		 383 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  70.45 
 
 		 380 aa  544  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3686  rod shape-determining protein RodA  71.92 
 
 		 383 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  70.45 
 
 		 380 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  59.74 
 
 		 384 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  59.68 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  59.58 
 
 		 384 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  61.58 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  59.32 
 
 		 384 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  60.89 
 
 		 385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  59.57 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  59.57 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1742  rod shape-determining protein RodA  61.78 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  61.58 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2025  rod shape-determining protein RodA  63.14 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0161321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  59.31 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  58.05 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2191  rod shape-determining protein RodA  56.91 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  58.91 
 
 		 380 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  52.49 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  53.56 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  51.79 
 
 		 368 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  53.54 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  51.52 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  51.52 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  51.52 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  52.44 
 
 		 372 aa  335  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  51.73 
 
 		 373 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  50.96 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  52.15 
 
 		 368 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  52.15 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  52.15 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  52.15 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  51.7 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  51.14 
 
 		 368 aa  329  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  51 
 
 		 368 aa  328  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  51.24 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  46.32 
 
 		 374 aa  325  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  51.14 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 		 373 aa  318  7e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  49.42 
 
 		 371 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  49.56 
 
 		 373 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  47.14 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  49.87 
 
 		 373 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  50.43 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  46.7 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  45.74 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  46.7 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  49.45 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  48.35 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  50.58 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  48.35 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  48.63 
 
 		 370 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  41.64 
 
 		 403 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  41.49 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  49.56 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  48.61 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  48.68 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  48.68 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  49.18 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  48.9 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  49.18 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  50.58 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  48.42 
 
 		 370 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  50.73 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  47.28 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  46.75 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  49.71 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  49.54 
 
 		 380 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>