More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2408 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  91.79 
 
 
414 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  80.48 
 
 
413 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  80.48 
 
 
413 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  80.48 
 
 
413 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  91.53 
 
 
413 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  80.15 
 
 
414 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  99.76 
 
 
413 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  82.57 
 
 
414 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  80.48 
 
 
413 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  84.5 
 
 
413 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
413 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  82.32 
 
 
414 aa  670    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  92.98 
 
 
413 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
413 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  82.32 
 
 
414 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  93.7 
 
 
413 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  80.48 
 
 
413 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  80.48 
 
 
413 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  80.48 
 
 
413 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  59.14 
 
 
410 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  48.56 
 
 
401 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  51.8 
 
 
405 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  49.29 
 
 
410 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  48.57 
 
 
404 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  49.04 
 
 
406 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  48.1 
 
 
402 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  48.1 
 
 
402 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  45.58 
 
 
401 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  44.92 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  47.06 
 
 
420 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  43.76 
 
 
442 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  43.76 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  44.73 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  43.91 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  42.82 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  65.08 
 
 
501 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  45.9 
 
 
404 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  45.93 
 
 
417 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  42.86 
 
 
399 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  42.92 
 
 
438 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3791  protein of unknown function DUF1078 domain protein  66.12 
 
 
503 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  45.52 
 
 
415 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  44.29 
 
 
407 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  45.98 
 
 
423 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  45.84 
 
 
405 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  41.69 
 
 
440 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0143  putative flagellar hook protein FlgE  66.12 
 
 
503 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  44.16 
 
 
426 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  42.14 
 
 
407 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  42.14 
 
 
407 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  42.55 
 
 
407 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  41.25 
 
 
462 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  44.68 
 
 
405 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  44.81 
 
 
405 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  39.52 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  41.88 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  41.88 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  41.88 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  41.93 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  39.56 
 
 
451 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  43.06 
 
 
418 aa  282  9e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  40.5 
 
 
443 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  42.49 
 
 
403 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  42.49 
 
 
403 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  42.25 
 
 
403 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  42.49 
 
 
403 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  42.25 
 
 
403 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  38.13 
 
 
450 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  40.13 
 
 
437 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  39.66 
 
 
408 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  43.66 
 
 
404 aa  270  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  39.91 
 
 
437 aa  269  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  41.23 
 
 
401 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  41.23 
 
 
401 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  41.23 
 
 
401 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  40.61 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  40.76 
 
 
401 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  40.38 
 
 
402 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  38.07 
 
 
454 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  40.14 
 
 
402 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  40.14 
 
 
402 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.77 
 
 
400 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  39.95 
 
 
387 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  40.77 
 
 
400 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  39.58 
 
 
425 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.08 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.86 
 
 
430 aa  252  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  37.2 
 
 
453 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  36.78 
 
 
453 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  36.98 
 
 
453 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  36.78 
 
 
453 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  37.36 
 
 
453 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  37.42 
 
 
453 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  36.9 
 
 
459 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  35.96 
 
 
460 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  36.44 
 
 
453 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  37.06 
 
 
453 aa  242  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  35.6 
 
 
453 aa  242  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  36.76 
 
 
455 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  36.04 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>