More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2324 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  96.5 
 
 
428 aa  830  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
428 aa  858  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  78.01 
 
 
422 aa  656  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  93.46 
 
 
428 aa  813  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  85.98 
 
 
515 aa  742  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  86.18 
 
 
464 aa  743  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  93.46 
 
 
428 aa  813  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  85.98 
 
 
464 aa  743  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
428 aa  858  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  77.83 
 
 
425 aa  655  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  86.12 
 
 
429 aa  739  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  87.68 
 
 
423 aa  756  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
428 aa  858  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  74.23 
 
 
424 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  52.21 
 
 
424 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  52.21 
 
 
424 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  4.63502e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  51.69 
 
 
424 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  51.43 
 
 
424 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  51.17 
 
 
424 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  51.17 
 
 
424 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  51.43 
 
 
424 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  48.57 
 
 
424 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  48.33 
 
 
424 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  51.16 
 
 
422 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  51.16 
 
 
422 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  51.16 
 
 
422 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  51.16 
 
 
422 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  48.33 
 
 
424 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 
436 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  46.67 
 
 
436 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  46.19 
 
 
424 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  43.41 
 
 
427 aa  322  1e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  45.84 
 
 
419 aa  319  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  41.98 
 
 
428 aa  299  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  42.89 
 
 
441 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  42.68 
 
 
429 aa  283  3e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  82.04 
 
 
171 aa  275  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  82.04 
 
 
171 aa  275  1e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  82.04 
 
 
171 aa  275  1e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  82.04 
 
 
171 aa  275  1e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  33.58 
 
 
428 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  39.2 
 
 
403 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  39.1 
 
 
427 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  38.94 
 
 
403 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  40.25 
 
 
411 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  38.19 
 
 
426 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  36.73 
 
 
424 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  38.36 
 
 
440 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  38.21 
 
 
446 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  36.69 
 
 
427 aa  246  5e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.2 
 
 
780 aa  243  4e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  37.87 
 
 
421 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  39.11 
 
 
426 aa  240  3e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  39.11 
 
 
426 aa  240  3e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  38.54 
 
 
426 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  38.29 
 
 
426 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  38.61 
 
 
447 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.66 
 
 
790 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  37.91 
 
 
423 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.22 
 
 
777 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  46.12 
 
 
474 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  46.12 
 
 
474 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  46.12 
 
 
482 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  30.96 
 
 
413 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 
414 aa  189  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  32.57 
 
 
431 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  28.79 
 
 
396 aa  149  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  38.46 
 
 
272 aa  137  3e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  33.19 
 
 
266 aa  137  3e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 
387 aa  134  4e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76635e-05 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  32.91 
 
 
360 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  33.19 
 
 
362 aa  132  8e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  34.96 
 
 
351 aa  128  2e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3972  diguanylate phosphodiesterase  29.62 
 
 
387 aa  128  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 
416 aa  128  2e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.88 
 
 
773 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.59 
 
 
583 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.84 
 
 
605 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.11 
 
 
766 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
581 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.59 
 
 
583 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  35.29 
 
 
367 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  34.76 
 
 
584 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.06 
 
 
572 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.33 
 
 
584 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.22 
 
 
585 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 
585 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.68734e-06  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 
585 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.33 
 
 
584 aa  123  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.74 
 
 
590 aa  122  1e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  32.95 
 
 
584 aa  122  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.31 
 
 
632 aa  121  2e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.51 
 
 
585 aa  122  2e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.37032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
580 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.02 
 
 
883 aa  119  1e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  36.89 
 
 
357 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.48 
 
 
584 aa  117  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  37.04 
 
 
288 aa  116  9e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.29901e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  35.4 
 
 
357 aa  115  2e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>