More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2235 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  100 
 
 
321 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  100 
 
 
321 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  96.57 
 
 
321 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  95.64 
 
 
321 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  95.64 
 
 
321 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  100 
 
 
279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  90.65 
 
 
321 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  78.57 
 
 
319 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  75.78 
 
 
338 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  81.82 
 
 
321 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  81.82 
 
 
338 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  81.82 
 
 
321 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  81.82 
 
 
338 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  81.82 
 
 
321 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  81.82 
 
 
321 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  79.62 
 
 
338 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  77.33 
 
 
321 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  49.19 
 
 
300 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  49.2 
 
 
333 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  49.66 
 
 
313 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  48.67 
 
 
367 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  47.64 
 
 
313 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  45.74 
 
 
297 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  46.2 
 
 
320 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  41.64 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  40.62 
 
 
291 aa  199  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  39.3 
 
 
309 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  36.95 
 
 
284 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  36.95 
 
 
284 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  39.37 
 
 
309 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  42.55 
 
 
291 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  41.07 
 
 
306 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  41.75 
 
 
291 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  40.91 
 
 
295 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  37.25 
 
 
292 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  36.93 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  40.2 
 
 
290 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  36.75 
 
 
266 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  33.66 
 
 
281 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  33.66 
 
 
281 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  37.54 
 
 
310 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  36.28 
 
 
300 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  40.42 
 
 
310 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  37.67 
 
 
302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  38.01 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  36.11 
 
 
300 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  37.06 
 
 
300 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  36.09 
 
 
295 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  35.76 
 
 
295 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  36.93 
 
 
317 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  37.29 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  37.63 
 
 
305 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  34.63 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  37.28 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  35.08 
 
 
304 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.35 
 
 
558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
251 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  31.83 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.72 
 
 
272 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  33.69 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
267 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 
268 aa  92.4  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  29.63 
 
 
262 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  31.88 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
278 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  32.73 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.15 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.45 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
290 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
267 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  27.21 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  31.12 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  33.51 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30.17 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.31 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  26.98 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  31.18 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  29.85 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  30.64 
 
 
276 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  34.24 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  33.9 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  33.15 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  32.61 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  35.47 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  35.47 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  35.23 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  30.91 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  34.66 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  22.5 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  27.07 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>