206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2225 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  96.2 
 
 
369 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  98.11 
 
 
370 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  99.73 
 
 
370 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
370 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
370 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  96.2 
 
 
369 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  95.92 
 
 
369 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  95.92 
 
 
369 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  95.92 
 
 
369 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  96.47 
 
 
369 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  95.92 
 
 
369 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  95.65 
 
 
369 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  95.95 
 
 
370 aa  620  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  95.41 
 
 
370 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  94.59 
 
 
370 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  87.77 
 
 
369 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  88.86 
 
 
369 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  89.67 
 
 
369 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  64.18 
 
 
363 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  63.04 
 
 
367 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  63.9 
 
 
363 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  63.61 
 
 
363 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  63.36 
 
 
367 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  53.1 
 
 
396 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  53.12 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  53.57 
 
 
383 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  50.13 
 
 
392 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  51.19 
 
 
404 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  50.92 
 
 
391 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  46.49 
 
 
376 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  49.59 
 
 
407 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  47.77 
 
 
373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  50.66 
 
 
398 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  46.32 
 
 
406 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  47 
 
 
506 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  43.59 
 
 
411 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  48.15 
 
 
327 aa  236  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  45.05 
 
 
348 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  44.69 
 
 
359 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  37.92 
 
 
339 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  40.44 
 
 
328 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  35.36 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  46.62 
 
 
359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  45.98 
 
 
359 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  38.94 
 
 
335 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  38.89 
 
 
325 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  38.32 
 
 
335 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  37.46 
 
 
339 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  44.35 
 
 
357 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  46.42 
 
 
357 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  40.29 
 
 
368 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  43.45 
 
 
339 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  42.51 
 
 
345 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  38.39 
 
 
326 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  44.05 
 
 
357 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  45.6 
 
 
359 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  34.39 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  39.57 
 
 
327 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  45.78 
 
 
361 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.42 
 
 
387 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  33.16 
 
 
387 aa  192  7e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  35.01 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  42.02 
 
 
327 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  38.04 
 
 
327 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  38.04 
 
 
325 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  43.15 
 
 
342 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  45.16 
 
 
356 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  36.56 
 
 
330 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  39.81 
 
 
327 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  38.11 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
325 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
325 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
325 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  36.28 
 
 
325 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  34.68 
 
 
352 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 
356 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  33.53 
 
 
352 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  33.53 
 
 
352 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.77 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  34.5 
 
 
375 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  35.38 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  33.14 
 
 
671 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  29.17 
 
 
327 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  28.08 
 
 
326 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.03 
 
 
311 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  34.67 
 
 
313 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  34.67 
 
 
313 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.85 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  37.09 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  26.3 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  31.07 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  32.2 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  30.29 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  26.98 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  30.62 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  34.64 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  34.8 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.35 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>