More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2147 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  70.61 
 
 		 580 aa  771    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  86.93 
 
 		 609 aa  967    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  89.66 
 
 		 584 aa  1009    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  68.89 
 
 		 565 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  68.09 
 
 		 565 aa  764    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  100 
 
 		 590 aa  1164    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  100 
 
 		 590 aa  1164    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  86.45 
 
 		 609 aa  979    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  55.65 
 
 		 570 aa  591  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  57.24 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  44.78 
 
 		 593 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  56.35 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  52.03 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  44.72 
 
 		 569 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  43.48 
 
 		 448 aa  351  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  47.81 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  42.57 
 
 		 450 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  42.34 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  44.42 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  43.07 
 
 		 501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 615 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 		 568 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  29.03 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 551 aa  120  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  29.41 
 
 		 457 aa  120  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  27.98 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  24 
 
 		 448 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  27.33 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4174  hypothetical protein  54.26 
 
 		 99 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  27.61 
 
 		 453 aa  98.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  27.49 
 
 		 524 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  29.07 
 
 		 459 aa  97.1  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  28.89 
 
 		 591 aa  95.1  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  28.07 
 
 		 454 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  28.07 
 
 		 454 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  27.87 
 
 		 454 aa  93.6  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  28.04 
 
 		 393 aa  93.6  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  26.69 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  26 
 
 		 455 aa  91.7  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  28.09 
 
 		 454 aa  91.3  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  26.84 
 
 		 454 aa  90.1  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  47.06 
 
 		 100 aa  87.8  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  27.16 
 
 		 454 aa  87.4  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  45.92 
 
 		 109 aa  87.4  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  25.49 
 
 		 459 aa  87.4  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  27.34 
 
 		 454 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  27.59 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  27.32 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  27.34 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2747  hypothetical protein  51.76 
 
 		 105 aa  84.7  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.168123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 		 453 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  26.35 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1890  putative acid-CoA ligase  26.76 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  23.28 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  25.06 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.21 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.65 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  22.02 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  30.72 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  27.85 
 
 		 2875 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  27.07 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0133  AMP-dependent synthetase and ligase  24.58 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  24.31 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  26.15 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  23.58 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2182  hypothetical protein  30.4 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  26.9 
 
 		 5596 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  27.6 
 
 		 1070 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  26.93 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  25.88 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.39 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  22.93 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  25.88 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  26.46 
 
 		 2628 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  27.39 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2155  hypothetical protein  24.22 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  25.48 
 
 		 663 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  25.53 
 
 		 511 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>