45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2018 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  97.2 
 
 		 107 aa  181  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  96.26 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  96.26 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  96.23 
 
 		 107 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  84.11 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  84.11 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  83.18 
 
 		 107 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  80 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  79.05 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  76.64 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  56.19 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  55.24 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  54.72 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  47.62 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  41.12 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  43.93 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  53.33 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  42.2 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  40.95 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  42.06 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  49.06 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  38.18 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  37.04 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  37.38 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  34.29 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  29.41 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38.68 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  30.56 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>