More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1897 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  81.67 
 
 
450 aa  700    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  82.63 
 
 
449 aa  700    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  81.67 
 
 
450 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  98.67 
 
 
505 aa  878    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  82.63 
 
 
449 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  81.67 
 
 
450 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  97.02 
 
 
454 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  87.31 
 
 
462 aa  722    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  82.59 
 
 
450 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  81.67 
 
 
450 aa  700    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  81.44 
 
 
450 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
461 aa  908    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  88.94 
 
 
460 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  99.78 
 
 
461 aa  905    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  89.8 
 
 
460 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  71.43 
 
 
451 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  71.9 
 
 
451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  68.34 
 
 
451 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  48.72 
 
 
458 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  49.4 
 
 
457 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  48.26 
 
 
457 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  47.52 
 
 
456 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  47.53 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  41.63 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 
420 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  35.1 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  38.06 
 
 
444 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  38.13 
 
 
412 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  43.52 
 
 
451 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  43.24 
 
 
427 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  37.5 
 
 
435 aa  239  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 
426 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 
452 aa  216  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 
437 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  39.34 
 
 
322 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  36.56 
 
 
422 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  38.68 
 
 
451 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  34.49 
 
 
456 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  37.46 
 
 
437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 
437 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  37 
 
 
435 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  36.79 
 
 
440 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  34.97 
 
 
427 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  38.18 
 
 
432 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  34.97 
 
 
427 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  35.45 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  33.78 
 
 
439 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  36.39 
 
 
475 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  37.9 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  42.35 
 
 
298 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 
864 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 
299 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 
840 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 
291 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.14 
 
 
806 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.33 
 
 
1144 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 
859 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  29.55 
 
 
287 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  38.03 
 
 
861 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 
843 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 
1111 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 
844 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 
784 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 
843 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  30.22 
 
 
441 aa  136  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  38.12 
 
 
830 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  38.95 
 
 
1130 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  34.92 
 
 
1120 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  34.92 
 
 
1118 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 
1166 aa  133  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  34.92 
 
 
1120 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 
1120 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  34.92 
 
 
1120 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  34.92 
 
 
1120 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  34.92 
 
 
1120 aa  133  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  34.92 
 
 
1120 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  34.92 
 
 
1120 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  37.69 
 
 
637 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 
1127 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 
447 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 
685 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 
1105 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  38.27 
 
 
1133 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  38.39 
 
 
1098 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 
842 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 
636 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 
636 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
807 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  36.12 
 
 
1118 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  36.12 
 
 
1120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  36.12 
 
 
1118 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  36.12 
 
 
1120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
860 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>