36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1693 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  98.94 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  93.62 
 
 		 189 aa  363  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  92.51 
 
 		 189 aa  358  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  87.77 
 
 		 188 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  87.77 
 
 		 188 aa  344  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  74.73 
 
 		 269 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  74.73 
 
 		 272 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  73.91 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  73.91 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  73.91 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  73.91 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  73.91 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  75.68 
 
 		 149 aa  227  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  63.54 
 
 		 238 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  61.14 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  39.18 
 
 		 217 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  39.41 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  36.75 
 
 		 217 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  38.52 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  38.52 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  29.75 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  28.19 
 
 		 379 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  32.43 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  34.25 
 
 		 361 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  28.46 
 
 		 395 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  30.08 
 
 		 350 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  28.79 
 
 		 347 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  30.57 
 
 		 363 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  23.21 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  23.21 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>