More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1516 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  99.47 
 
 		 376 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  100 
 
 		 376 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  100 
 
 		 376 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  56.33 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  52.06 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  54.01 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  53.33 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  54.01 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  54.01 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  53.59 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  54.01 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  54.01 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  54.01 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  56.3 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  56.57 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  56.3 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  56.3 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  56.57 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  56.3 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  56.57 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  54.69 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  54.47 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  55.01 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  52.47 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  54.47 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  54.47 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  49.74 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  52.42 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  52.2 
 
 		 385 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  52.93 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  56.39 
 
 		 376 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  52.75 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  51.94 
 
 		 384 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  51.94 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  51.75 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  51.94 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  51.94 
 
 		 384 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  51.94 
 
 		 384 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  51.94 
 
 		 411 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  51.94 
 
 		 384 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  53.02 
 
 		 523 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  52.07 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  52.07 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  51.79 
 
 		 385 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  50 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  50.26 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  50.96 
 
 		 388 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  49.09 
 
 		 386 aa  338  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  47.65 
 
 		 404 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  50 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  44.85 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  45.34 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  46.02 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.95 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.7 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.7 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.7 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.67 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.7 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.7 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.7 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.67 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.75 
 
 		 397 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  45.33 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  45.33 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.95 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.95 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.95 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.44 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.95 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  42.39 
 
 		 397 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  42.86 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.08 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.08 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.83 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.86 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  44.06 
 
 		 445 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.93 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.93 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.93 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.36 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  43.41 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.17 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.17 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  40.1 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  43.67 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  41.75 
 
 		 402 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  41.23 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  40.61 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.28 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43.29 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.15 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  41.21 
 
 		 395 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  41.62 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  41.5 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>