More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1336 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6326  malto-oligosyltrehalose synthase  84.66 
 
 
924 aa  1496    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0514594  normal  0.0507365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6827  malto-oligosyltrehalose synthase  56.31 
 
 
951 aa  980    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.554388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24880  maltooligosyl trehalose synthase  47.57 
 
 
917 aa  698    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.022043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4053  maltooligosyl trehalose synthase  45.69 
 
 
924 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114095  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05188  putative maltooligosyl trehalose synthase transmembrane protein  48.63 
 
 
940 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3128  glycosyl hydrolase, family 13  45.84 
 
 
927 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0816  maltooligosyl trehalose synthase, putative  69.53 
 
 
930 aa  1142    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.133141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2995  maltooligosyl trehalose synthase  45.32 
 
 
927 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506264  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1733  malto-oligosyltrehalose synthase  69.53 
 
 
967 aa  1140    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2546  maltooligosyl trehalose synthase  43.96 
 
 
925 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7028  maltooligosyl trehalose synthase  85.48 
 
 
923 aa  1472    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1790  maltooligosyl trehalose synthase  45.58 
 
 
924 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571899  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0615  malto-oligosyltrehalose synthase  69.53 
 
 
930 aa  1142    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1416  malto-oligosyltrehalose synthase  44.26 
 
 
941 aa  703    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0169587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2867  putative glycosyl hydrolase  55.93 
 
 
952 aa  972    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1336  malto-oligosyltrehalose synthase  100 
 
 
921 aa  1810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253875  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3933  malto-oligosyltrehalose synthase  47.79 
 
 
940 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.734301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1460  malto-oligosyltrehalose synthase  46.82 
 
 
918 aa  694    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251406  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6082  malto-oligosyltrehalose synthase  98.05 
 
 
922 aa  1747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5596  malto-oligosyltrehalose synthase  85.04 
 
 
924 aa  1487    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49211  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36605  maltooligosyl trehalose synthase  46.33 
 
 
926 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6493  malto-oligosyltrehalose synthase  99.89 
 
 
921 aa  1807    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5485  malto-oligosyltrehalose synthase  84.37 
 
 
920 aa  1403    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1821  maltooligosyl trehalose synthase  45.57 
 
 
924 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3144  maltooligosyl trehalose synthase  46.71 
 
 
926 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2280  maltooligosyl trehalose synthase  48.21 
 
 
914 aa  711    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0184477  hitchhiker  0.00895039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3652  maltooligosyl trehalose synthase  45.45 
 
 
924 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116704  normal  0.178483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4046  malto-oligosyltrehalose synthase  47.79 
 
 
940 aa  701    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240234  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1334  malto-oligosyltrehalose synthase  69.53 
 
 
930 aa  1142    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.929488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0540  malto-oligosyltrehalose synthase  69.53 
 
 
930 aa  1142    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4387  malto-oligosyltrehalose synthase  55.91 
 
 
944 aa  951    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454726 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1539  alpha-amylase family protein  69.75 
 
 
930 aa  1159    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1562  malto-oligosyltrehalose synthase  69.42 
 
 
930 aa  1141    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.497391  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4234  alpha amylase domain-containing protein  43.37 
 
 
884 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0546  malto-oligosyltrehalose synthase  44.53 
 
 
836 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6326  putative glycosyl hydrolase (glycosidase)  41.26 
 
 
934 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.420864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0946  alpha amylase  41.58 
 
 
948 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206835  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3487  malto-oligosyltrehalose synthase  42.86 
 
 
929 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  42.5 
 
 
1703 aa  591  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4168  malto-oligosyltrehalose synthase  42.79 
 
 
928 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03372  malto-oligosyltrehalose synthase  43.38 
 
 
869 aa  588  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3682  malto-oligosyltrehalose synthase  43.5 
 
 
926 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1738  malto-oligosyltrehalose synthase  40.61 
 
 
969 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.137829  hitchhiker  0.0000132957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0507  Alpha amylase, catalytic region  42.78 
 
 
939 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2081  alpha-amylase family protein  40.61 
 
 
969 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  40.13 
 
 
1642 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.26 
 
 
1715 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2094  maltooligosyl trehalose synthase  38.83 
 
 
986 aa  567  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1461  malto-oligosyltrehalose synthase  41.82 
 
 
950 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.02 
 
 
1673 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0319  malto-oligosyltrehalose synthase  42.3 
 
 
913 aa  568  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1879  malto-oligosyltrehalose synthase  42.6 
 
 
928 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  41.39 
 
 
1647 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1395  malto-oligosyltrehalose synthase  34.2 
 
 
942 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1429  malto-oligosyltrehalose synthase  33.99 
 
 
942 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0930429  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2673  malto-oligosyltrehalose synthase  40.32 
 
 
856 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0134  maltooligosyl trehalose synthase  36.01 
 
 
994 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0115  maltooligosyl trehalose synthase  36.24 
 
 
994 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.136948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.41 
 
 
1650 aa  545  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.42 
 
 
1646 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  38.75 
 
 
1646 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1427  Alpha amylase, catalytic region  34.7 
 
 
922 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.627603  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.85 
 
 
1730 aa  532  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3267  maltooligosyl trehalose synthase  35.43 
 
 
995 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  37.82 
 
 
1662 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1600  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  39.69 
 
 
1633 aa  529  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290516  hitchhiker  0.00115838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1680  (1,4)-alpha-D-glucan 1-alpha-D-glucosylmutase  36.96 
 
 
940 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2351  malto-oligosyltrehalose synthase  36.45 
 
 
955 aa  525  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3468  maltooligosyl trehalose synthase  35.76 
 
 
994 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1811  malto-oligosyltrehalose synthase  37.41 
 
 
955 aa  519  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7155  malto-oligosyltrehalose synthase  38.98 
 
 
869 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4620  malto-oligosyltrehalose synthase  33.58 
 
 
930 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.026371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2360  maltooligosyl trehalose synthase  35.48 
 
 
996 aa  512  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1736  malto-oligosyltrehalose synthase  38.36 
 
 
842 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1784  malto-oligosyltrehalose synthase  38.36 
 
 
842 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1673  malto-oligosyltrehalose synthase  38.36 
 
 
842 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1606  malto-oligosyltrehalose synthase  38.36 
 
 
842 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.630708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2452  maltooligosyl trehalose synthase  39.22 
 
 
871 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2763  malto-oligosyltrehalose synthase  34.35 
 
 
1007 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200258  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6007  malto-oligosyltrehalose synthase  38.34 
 
 
869 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.074206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1671  malto-oligosyltrehalose synthase  38.36 
 
 
842 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1779  maltooligosyl trehalose synthase  40.48 
 
 
873 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4561  malto-oligosyltrehalose synthase  39.18 
 
 
879 aa  502  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0317  maltooligosyl trehalose synthase  37.81 
 
 
1013 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0021368  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5462  malto-oligosyltrehalose synthase  37.79 
 
 
843 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1115  maltooligosyl trehalose synthase  39.55 
 
 
871 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0539  malto-oligosyltrehalose synthase  37.05 
 
 
944 aa  490  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2012  malto-oligosyltrehalose synthase  38.2 
 
 
945 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5282  malto-oligosyltrehalose synthase  35.22 
 
 
1411 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.339944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0304  maltooligosyl trehalose synthase  38.33 
 
 
1007 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0293  maltooligosyl trehalose synthase  38.44 
 
 
1009 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3378  malto-oligosyltrehalose synthase  37.9 
 
 
848 aa  458  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0155  malto-oligosyltrehalose synthase  33.33 
 
 
1405 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0315  maltooligosyl trehalose synthase  38.42 
 
 
1007 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4211  maltooligosyl trehalose synthase  37.04 
 
 
875 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3112  malto-oligosyltrehalose synthase  33.76 
 
 
935 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2573  malto-oligosyltrehalose synthase  31.96 
 
 
875 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0039  malto-oligosyltrehalose synthase  36.66 
 
 
909 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2602  a-glycosidase, maltooligosyl trehalose synthase, glycoside hydrolase family 13 protein  30.09 
 
 
916 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1349  malto-oligosyltrehalose synthase  36.27 
 
 
831 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>