More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1292 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  99.44 
 
 
434 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
354 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  95.47 
 
 
353 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  82.95 
 
 
352 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  81.82 
 
 
352 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  81.09 
 
 
370 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  70.25 
 
 
381 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  69.55 
 
 
372 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  69.23 
 
 
372 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  58.16 
 
 
338 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  58.77 
 
 
355 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  59.27 
 
 
342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  56.45 
 
 
346 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
353 aa  332  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  43.79 
 
 
346 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  45.37 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  53.92 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  49.79 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  41.21 
 
 
311 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  41.35 
 
 
326 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  40.91 
 
 
334 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  43.87 
 
 
327 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  41.75 
 
 
352 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  43.22 
 
 
338 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  42.24 
 
 
330 aa  222  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  41.48 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.79 
 
 
354 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  38.83 
 
 
336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  39.88 
 
 
334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  44.77 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  43.87 
 
 
371 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  38.26 
 
 
370 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  39.62 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 
359 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  40.32 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  48.15 
 
 
315 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  45.54 
 
 
345 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  41.57 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 
351 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  40.78 
 
 
324 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 
425 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  40.24 
 
 
435 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
349 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  28.96 
 
 
349 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.8 
 
 
355 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  35.46 
 
 
234 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  48.76 
 
 
235 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.7 
 
 
316 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  37.44 
 
 
232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  36.53 
 
 
298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  34.1 
 
 
301 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  43.36 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  37.62 
 
 
261 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.36 
 
 
330 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  30.24 
 
 
374 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  29.84 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  25.57 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  28.35 
 
 
528 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  27.14 
 
 
389 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.67 
 
 
421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  26.87 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  26.49 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  25.63 
 
 
385 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 
313 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.35 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  26.43 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  25.74 
 
 
373 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  24.81 
 
 
385 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.22 
 
 
405 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.25 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  33.82 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  27.82 
 
 
513 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.42 
 
 
384 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.46 
 
 
362 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  29.74 
 
 
382 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 
422 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.15 
 
 
401 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  28.5 
 
 
304 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  37.06 
 
 
272 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 
378 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  27.4 
 
 
392 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>