123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1034 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  75.13 
 
 
559 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  75.31 
 
 
559 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  92.16 
 
 
561 aa  1036    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  75.49 
 
 
597 aa  851    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  72.39 
 
 
569 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  100 
 
 
561 aa  1140    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  91.44 
 
 
561 aa  1035    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
561 aa  1140    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  75.93 
 
 
551 aa  841    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  75.93 
 
 
551 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  76.11 
 
 
551 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  76.11 
 
 
551 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  75.93 
 
 
551 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  90.55 
 
 
561 aa  1024    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  71.3 
 
 
569 aa  824    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  96.43 
 
 
561 aa  1071    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  91.27 
 
 
561 aa  1034    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  44.44 
 
 
557 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  44.18 
 
 
581 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  44.18 
 
 
581 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  44.48 
 
 
555 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  42.11 
 
 
558 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  39.11 
 
 
565 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  35.01 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.82 
 
 
554 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  30.02 
 
 
574 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.14 
 
 
554 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.44 
 
 
552 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.2 
 
 
559 aa  213  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  27.67 
 
 
588 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.03 
 
 
572 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.62 
 
 
568 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.09 
 
 
568 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.25 
 
 
599 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  26.2 
 
 
587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.22 
 
 
592 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  24.61 
 
 
624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  27.27 
 
 
607 aa  114  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.15 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.8 
 
 
560 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.05 
 
 
553 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.65 
 
 
572 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.41 
 
 
587 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.08 
 
 
589 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  24.34 
 
 
607 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.96 
 
 
583 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.81 
 
 
747 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.22 
 
 
548 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.69 
 
 
567 aa  89.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.7 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.25 
 
 
692 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  20.81 
 
 
550 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.61 
 
 
592 aa  77  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  22.46 
 
 
548 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.03 
 
 
586 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.57 
 
 
590 aa  76.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  25.33 
 
 
545 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.24 
 
 
585 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  23.04 
 
 
554 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  25.21 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.76 
 
 
576 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  24.79 
 
 
567 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  24.79 
 
 
567 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  28.05 
 
 
595 aa  70.5  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  23.06 
 
 
558 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.41 
 
 
571 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.35 
 
 
592 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  21.7 
 
 
585 aa  67  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.72 
 
 
578 aa  66.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.7 
 
 
569 aa  65.1  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23 
 
 
538 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.08 
 
 
561 aa  64.7  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  32.35 
 
 
588 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.43 
 
 
584 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.44 
 
 
541 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24 
 
 
1391 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.43 
 
 
639 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  34.58 
 
 
584 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  22.69 
 
 
562 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  22.69 
 
 
562 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.55 
 
 
1349 aa  60.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  28.48 
 
 
575 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25 
 
 
692 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.25 
 
 
1570 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.97 
 
 
580 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  21.25 
 
 
531 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  21.58 
 
 
547 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 
595 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  22.2 
 
 
562 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  22.2 
 
 
565 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.05 
 
 
568 aa  55.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.65 
 
 
585 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  31.75 
 
 
608 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.68 
 
 
554 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.28 
 
 
554 aa  53.9  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  20.56 
 
 
442 aa  53.5  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  30.82 
 
 
555 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.4 
 
 
579 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  35 
 
 
595 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  22.33 
 
 
555 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>