More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0989 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  93.58 
 
 
297 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  92.62 
 
 
298 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  93.24 
 
 
298 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  90.27 
 
 
298 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  70.39 
 
 
306 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  73.49 
 
 
301 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  67.82 
 
 
304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  72.15 
 
 
448 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  72.15 
 
 
325 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  72.15 
 
 
378 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  71.81 
 
 
421 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  72.15 
 
 
448 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  72.15 
 
 
448 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  71.81 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  62.85 
 
 
323 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 
304 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  59.72 
 
 
294 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  61.46 
 
 
289 aa  351  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  60.76 
 
 
289 aa  348  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  63.07 
 
 
293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  51.44 
 
 
607 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  50.72 
 
 
626 aa  304  9.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 
284 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  55.94 
 
 
300 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  52.41 
 
 
296 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  52.43 
 
 
323 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  50.89 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  49.82 
 
 
311 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  47.46 
 
 
299 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 
292 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
335 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.46 
 
 
287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  45.87 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
330 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  44.62 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 
286 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 
302 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 
283 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  42.5 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  36.11 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  40.99 
 
 
279 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  35.99 
 
 
300 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  31.93 
 
 
284 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  32.31 
 
 
283 aa  185  8e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
292 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 
285 aa  142  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.59 
 
 
284 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
274 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  36.07 
 
 
274 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
299 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  34.68 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.29 
 
 
274 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  36.33 
 
 
295 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
290 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  32.27 
 
 
305 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.2 
 
 
275 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
307 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
298 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 
298 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
290 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
307 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  34.98 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  27.94 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  38.32 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  22.39 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  33.06 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>