More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0912 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1394  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 310 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4537  LysR family transcriptional regulator  95.1 
 
 		 307 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  91.53 
 
 		 307 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  90.88 
 
 		 324 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  66.01 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  57.67 
 
 		 301 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  57.43 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  55.52 
 
 		 302 aa  335  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1169  transcriptional regulator, LysR family  55.12 
 
 		 308 aa  325  6e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4932  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2812  LysR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 305 aa  322  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.110516 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1284  LysR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 315 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2152  LysR substrate-binding  55.12 
 
 		 313 aa  309  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0841975  normal  0.836129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2112  transcriptional regulator, LysR family  55.12 
 
 		 313 aa  308  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2429  transcriptional regulator, LysR family  55.12 
 
 		 313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  52.84 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0968  LysR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.564507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0980  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 302 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4504  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4350  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0786  LysR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4608  LysR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.612778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3692  LysR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0981  transcriptional regulator, LysR family  50.85 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3233  LysR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0434  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.27 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  41.91 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.88 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0562  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.293612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.8 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  38.72 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  41.28 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>