More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0661 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  97.3 
 
 
185 aa  373  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  95.68 
 
 
185 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  95.68 
 
 
185 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  94.05 
 
 
185 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  92.43 
 
 
185 aa  362  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  92.97 
 
 
185 aa  360  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  92.97 
 
 
185 aa  360  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  92.97 
 
 
185 aa  360  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  92.97 
 
 
185 aa  360  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  92.97 
 
 
185 aa  360  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  92.97 
 
 
185 aa  360  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  92.97 
 
 
185 aa  360  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  88.65 
 
 
185 aa  340  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  88.11 
 
 
185 aa  339  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  87.57 
 
 
185 aa  338  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  81.08 
 
 
186 aa  313  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  80 
 
 
186 aa  310  6.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  81.08 
 
 
186 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  80.54 
 
 
186 aa  308  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  75.68 
 
 
188 aa  296  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  77.72 
 
 
185 aa  296  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  77.17 
 
 
185 aa  290  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  76.09 
 
 
185 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  70.65 
 
 
184 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  70.65 
 
 
199 aa  270  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  68.82 
 
 
186 aa  266  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  67.38 
 
 
188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  66.84 
 
 
189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  70.11 
 
 
184 aa  264  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  69.02 
 
 
184 aa  262  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  69.02 
 
 
184 aa  262  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  67.93 
 
 
184 aa  262  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  69.57 
 
 
184 aa  262  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  66.67 
 
 
188 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  66.67 
 
 
188 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  67.93 
 
 
184 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  67.93 
 
 
184 aa  255  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  66.3 
 
 
184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  65.76 
 
 
184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  66.49 
 
 
191 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  66.49 
 
 
191 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  58.82 
 
 
186 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  58.06 
 
 
186 aa  227  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  56.68 
 
 
186 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  57.75 
 
 
188 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  56.45 
 
 
186 aa  222  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  56.15 
 
 
186 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  54.3 
 
 
186 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  58.06 
 
 
186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  208  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  208  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  208  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  55.38 
 
 
190 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  53.19 
 
 
189 aa  192  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  50.79 
 
 
189 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  50.79 
 
 
189 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  50.26 
 
 
189 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  49.47 
 
 
189 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  49.47 
 
 
189 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  49.47 
 
 
189 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  49.47 
 
 
189 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  44.74 
 
 
190 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  39.78 
 
 
185 aa  144  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  40 
 
 
186 aa  143  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  37.63 
 
 
185 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  36.76 
 
 
187 aa  138  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  40 
 
 
191 aa  137  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  36.76 
 
 
187 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  38.17 
 
 
185 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  36.56 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  37.43 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  36.76 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  35.68 
 
 
187 aa  131  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  37.84 
 
 
187 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  37.16 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  35.14 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  35.14 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  37.3 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  35.14 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  37.3 
 
 
185 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  35.68 
 
 
187 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  34.05 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  32.97 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  37.84 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  32.97 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  34.95 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  37.63 
 
 
185 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  34.05 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  35.68 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  36.56 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  32.97 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>