89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0479 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0479  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0920  hypothetical protein  97.67 
 
 		 172 aa  350  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0828  hypothetical protein  94.77 
 
 		 172 aa  342  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4059  hypothetical protein  95.91 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2439  hypothetical protein  96.51 
 
 		 171 aa  339  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0819  hypothetical protein  93.6 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1995  hypothetical protein  82.04 
 
 		 169 aa  287  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938278  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5053  helix-turn-helix domain-containing protein  80.72 
 
 		 168 aa  285  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4777  hypothetical protein  80.84 
 
 		 169 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00674885  hitchhiker  0.00133084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2016  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3295  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2441  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2540  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1287  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1518  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2397  hypothetical protein  61.31 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0055  hypothetical protein  61.08 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00670  hypothetical protein  60.48 
 
 		 168 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1570  hypothetical protein  59.28 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3357  hypothetical protein  59.52 
 
 		 168 aa  204  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.844459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1850  hypothetical protein  60.12 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1303  hypothetical protein  52.1 
 
 		 167 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2424  hypothetical protein  53.61 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2687  hypothetical protein  53.89 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3410  hypothetical protein  54.27 
 
 		 169 aa  180  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0847  hypothetical protein  51.5 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0979  hypothetical protein  51.2 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3710  hypothetical protein  55.29 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.617797  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5006  hypothetical protein  50.9 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4974  hypothetical protein  53.25 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2420  hypothetical protein  53.29 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.384209  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1903  hypothetical protein  50.89 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.522183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1821  hypothetical protein  52.38 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0923  hypothetical protein  57.67 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.52192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0858  hypothetical protein  57.67 
 
 		 169 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1091  hypothetical protein  49.1 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2989  hypothetical protein  50.3 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02104  hypothetical protein  53.37 
 
 		 170 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1303  hypothetical protein  50.6 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0061  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2000  hypothetical protein  48.55 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000379085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3857  hypothetical protein  50.6 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512206  normal  0.250482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1532  hypothetical protein  50.29 
 
 		 169 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4185  hypothetical protein  49.4 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0614  hypothetical protein  49.11 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2808  hypothetical protein  47.27 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1369  hypothetical protein  48.52 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1896  hypothetical protein  46.06 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5253  hypothetical protein  43.9 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.0494269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0238  hypothetical protein  41.21 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0235  hypothetical protein  40.61 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0241  hypothetical protein  40.61 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0235  hypothetical protein  40.61 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0239  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000143934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0345  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2185  hypothetical protein  39.63 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4492  hypothetical protein  42.21 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0562  hypothetical protein  41.21 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0238  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3783  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06423  conserved hypothetical protein  41.94 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0269408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1986  hypothetical protein  33.13 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000813375  normal  0.0326161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2170  hypothetical protein  36.53 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3797  hypothetical protein  35.5 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3056  hypothetical protein  31.76 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1561  hypothetical protein  32.57 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1182  hypothetical protein  32.39 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1662  hypothetical protein  32.39 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4810  hypothetical protein  33.14 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1580  hypothetical protein  32 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967848  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1217  hypothetical protein  33.11 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1579  hypothetical protein  30.29 
 
 		 403 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360622  normal  0.0697544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1636  hypothetical protein  32 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.722246  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2420  hypothetical protein  30.95 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0537843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3817  hypothetical protein  28.86 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3867  hypothetical protein  28.86 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1938  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1924  hypothetical protein  30.36 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0871  hypothetical protein  30.18 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0668164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2084  hypothetical protein  30.18 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0290  hypothetical protein  30.18 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0025701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1184  hypothetical protein  30.18 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1627  hypothetical protein  29.76 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2060  hypothetical protein  44.44 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4217  hypothetical protein  33.08 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3021  hypothetical protein  28.99 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2884  hypothetical protein  27.5 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>