More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0299 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  43 
 
 		 2492 aa  783    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  44 
 
 		 2468 aa  769    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  40.37 
 
 		 2500 aa  780    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  39.31 
 
 		 3101 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  89.4 
 
 		 2546 aa  4284    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  37.27 
 
 		 2523 aa  1285    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  39.39 
 
 		 2484 aa  1308    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.3 
 
 		 1939 aa  740    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.37 
 
 		 1144 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 		 2232 aa  698    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  89.36 
 
 		 2546 aa  4283    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 		 2460 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  91.95 
 
 		 2545 aa  4417    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  59.06 
 
 		 2556 aa  2726    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  39.88 
 
 		 2468 aa  1281    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  39.85 
 
 		 1832 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  69.92 
 
 		 2543 aa  3261    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.12 
 
 		 3111 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  41.2 
 
 		 2543 aa  954    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  37.22 
 
 		 2492 aa  1294    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 		 2485 aa  1326    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2544 aa  5043    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  40.03 
 
 		 2547 aa  1669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.37 
 
 		 2333 aa  741    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 		 2476 aa  773    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.48 
 
 		 2551 aa  1062    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  40.6 
 
 		 2486 aa  1544    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  99.96 
 
 		 2544 aa  5036    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  97.84 
 
 		 2545 aa  4683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.12 
 
 		 1804 aa  721    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  42.14 
 
 		 2499 aa  1617    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  40.68 
 
 		 2507 aa  897    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  89.44 
 
 		 2546 aa  4285    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  89.44 
 
 		 2546 aa  4285    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  89.32 
 
 		 2546 aa  4281    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 		 2352 aa  680    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  89.44 
 
 		 2546 aa  4286    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  40.6 
 
 		 2486 aa  1544    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.84 
 
 		 1909 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.53 
 
 		 1822 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  43.43 
 
 		 2468 aa  759    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.58 
 
 		 2230 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  89.44 
 
 		 2546 aa  4285    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 1874 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.83 
 
 		 3449 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  36.68 
 
 		 1966 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  35.98 
 
 		 2890 aa  606  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.15 
 
 		 3676 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.01 
 
 		 3176 aa  603  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  37.15 
 
 		 2126 aa  601  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.82 
 
 		 2225 aa  603  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.4 
 
 		 3679 aa  602  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  38.92 
 
 		 4607 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.15 
 
 		 2136 aa  596  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.75 
 
 		 1587 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 		 3693 aa  596  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 		 3693 aa  596  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 7110 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.85 
 
 		 3702 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.73 
 
 		 3508 aa  591  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.8 
 
 		 1656 aa  593  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  33.67 
 
 		 2462 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 		 3493 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.73 
 
 		 4151 aa  587  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  35.63 
 
 		 2220 aa  582  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  37.65 
 
 		 1831 aa  581  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.26 
 
 		 1087 aa  580  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  38.56 
 
 		 3158 aa  580  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.35 
 
 		 3696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 		 3645 aa  577  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  37.52 
 
 		 2846 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.85 
 
 		 2880 aa  574  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 5154 aa  572  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.66 
 
 		 3874 aa  572  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 		 7279 aa  573  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  37.05 
 
 		 2966 aa  573  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  34.92 
 
 		 3080 aa  573  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.58 
 
 		 2719 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  35.61 
 
 		 7210 aa  570  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  37.03 
 
 		 5255 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 2551 aa  566  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  37.58 
 
 		 4080 aa  566  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  38.39 
 
 		 2090 aa  561  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  35.23 
 
 		 1789 aa  563  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  40.82 
 
 		 2162 aa  560  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 		 1354 aa  560  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  33.71 
 
 		 1349 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.62 
 
 		 1349 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  40.42 
 
 		 1584 aa  560  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.9 
 
 		 6768 aa  557  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  35.47 
 
 		 3930 aa  556  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.36 
 
 		 1337 aa  556  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 		 3463 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 		 5400 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  36.73 
 
 		 3711 aa  556  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  35.84 
 
 		 4882 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  40.99 
 
 		 1580 aa  552  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  35.19 
 
 		 2085 aa  553  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  40.99 
 
 		 1580 aa  552  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  35.19 
 
 		 2085 aa  553  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>