82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0226 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  99.16 
 
 
238 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  93.31 
 
 
239 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  92.47 
 
 
240 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  84.94 
 
 
240 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  83.82 
 
 
242 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  78.42 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  73.21 
 
 
264 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  74.55 
 
 
256 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  74.55 
 
 
252 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  74.55 
 
 
256 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  74.55 
 
 
256 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  74.55 
 
 
239 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  74.55 
 
 
252 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  73.94 
 
 
252 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  63.35 
 
 
233 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  58.72 
 
 
233 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  55.76 
 
 
250 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  61.99 
 
 
248 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  43.78 
 
 
253 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  46.29 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  44.5 
 
 
236 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  38.34 
 
 
208 aa  121  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  38.05 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  37.11 
 
 
201 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  40.46 
 
 
192 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  37.13 
 
 
210 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  38.02 
 
 
196 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  34.87 
 
 
188 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  36.57 
 
 
195 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  33.03 
 
 
222 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  36.19 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  32.57 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  32.42 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  34.39 
 
 
199 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  30.93 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  32.32 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  36.9 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  34.73 
 
 
176 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  34.73 
 
 
176 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.42 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  33.15 
 
 
191 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  38.2 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  29.9 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  29.24 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  34.57 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  29.69 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  32.29 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  29.02 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  29.56 
 
 
197 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  32.91 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  33.75 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.9 
 
 
203 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  30.54 
 
 
205 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  29.76 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  29.76 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  29.76 
 
 
192 aa  49.3  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  27.55 
 
 
195 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  28.49 
 
 
186 aa  48.9  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  34.41 
 
 
200 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.74 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.35 
 
 
201 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  28.42 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  34.06 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  28.42 
 
 
182 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  28.42 
 
 
182 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  28.42 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  28.26 
 
 
187 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  28.26 
 
 
187 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  28.26 
 
 
187 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  28.26 
 
 
187 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  28.26 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.12 
 
 
211 aa  45.1  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  27.61 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  27.61 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  27.61 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  27.61 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  27.61 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.86 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  27.27 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  31.21 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>