More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0160 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  95.74 
 
 
399 aa  733  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  89.97 
 
 
399 aa  685  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  100 
 
 
385 aa  742  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  99.75 
 
 
399 aa  775  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  100 
 
 
399 aa  778  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  80.2 
 
 
399 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  83.38 
 
 
405 aa  538  1e-152  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  83.38 
 
 
399 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  83.38 
 
 
399 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  83.38 
 
 
399 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  83.38 
 
 
399 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  83.63 
 
 
399 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  83.12 
 
 
399 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  45.62 
 
 
406 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
406 aa  305  1e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  44.33 
 
 
399 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  44.33 
 
 
399 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  44.33 
 
 
399 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
399 aa  285  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  45.19 
 
 
394 aa  282  6e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.8 
 
 
393 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  45.19 
 
 
394 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  45.19 
 
 
394 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  44.41 
 
 
394 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  45.19 
 
 
394 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  44.68 
 
 
394 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  45.77 
 
 
399 aa  275  1e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  41.37 
 
 
426 aa  275  1e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  42.86 
 
 
394 aa  274  2e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
394 aa  274  2e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  42.86 
 
 
394 aa  274  2e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
394 aa  274  2e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  42.6 
 
 
394 aa  272  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  42.6 
 
 
394 aa  269  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
423 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 
403 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  41.67 
 
 
401 aa  259  5e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 
399 aa  255  1e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  40.89 
 
 
401 aa  253  4e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.62 
 
 
411 aa  253  5e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 
399 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  42.86 
 
 
383 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
404 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.09 
 
 
405 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  40.89 
 
 
401 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  41.92 
 
 
398 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  44.66 
 
 
404 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.59 
 
 
394 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  45.31 
 
 
399 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.68 
 
 
398 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  41.25 
 
 
405 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  38.17 
 
 
389 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  41.32 
 
 
405 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  38.17 
 
 
389 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  41.25 
 
 
416 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  44.65 
 
 
400 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  40.25 
 
 
405 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.79 
 
 
398 aa  244  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  40.25 
 
 
405 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.25 
 
 
405 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
391 aa  243  4e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  40.97 
 
 
411 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  40.97 
 
 
411 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  40.71 
 
 
411 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 
413 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  39.74 
 
 
395 aa  240  3e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  42.38 
 
 
401 aa  240  3e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  41.62 
 
 
401 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  42.97 
 
 
400 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  39.18 
 
 
402 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  43.67 
 
 
394 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  42.97 
 
 
400 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
394 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  42.74 
 
 
411 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  40 
 
 
410 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  43.32 
 
 
409 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
413 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  41.07 
 
 
390 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  44.41 
 
 
429 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  44.41 
 
 
398 aa  236  5e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  44.41 
 
 
429 aa  236  5e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  44.41 
 
 
398 aa  236  5e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  44.41 
 
 
398 aa  236  5e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  44.41 
 
 
398 aa  236  5e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  44.41 
 
 
398 aa  236  5e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  42.7 
 
 
400 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
389 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  41.34 
 
 
398 aa  235  1e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 
394 aa  234  2e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  40.36 
 
 
404 aa  234  2e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.08 
 
 
407 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 
422 aa  233  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  39.58 
 
 
404 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.87 
 
 
403 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
428 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
405 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  39.85 
 
 
414 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.5466e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  41.8 
 
 
411 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  40.15 
 
 
416 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  44.63 
 
 
402 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>