More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0123 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 150 aa  307  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 150 aa  307  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  99.33 
 
 		 150 aa  306  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  98 
 
 		 150 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  97.33 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  97.33 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  97.33 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  91.33 
 
 		 207 aa  288  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 		 207 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 		 207 aa  284  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 		 150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 		 150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 		 150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 		 150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  90.67 
 
 		 150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  88.08 
 
 		 151 aa  276  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  87.42 
 
 		 151 aa  273  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  88.19 
 
 		 154 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  77.03 
 
 		 162 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  75.68 
 
 		 162 aa  223  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  72.73 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  71.23 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  71.23 
 
 		 155 aa  220  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 148 aa  217  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  73.38 
 
 		 141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  68.46 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  68.46 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  71.03 
 
 		 151 aa  205  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  69.66 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  69.66 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  65.99 
 
 		 149 aa  203  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  70.83 
 
 		 151 aa  202  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  70.83 
 
 		 151 aa  202  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  70.83 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  68.49 
 
 		 148 aa  201  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  69.44 
 
 		 150 aa  199  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  66.21 
 
 		 148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  66.21 
 
 		 147 aa  195  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.83 
 
 		 146 aa  194  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  64.34 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.45 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 149 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  63.45 
 
 		 179 aa  185  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  62.76 
 
 		 149 aa  185  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  63.24 
 
 		 153 aa  183  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0032  3-dehydroquinate dehydratase  63.89 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  63.89 
 
 		 244 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.19 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.96 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 152 aa  180  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  62.76 
 
 		 145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.96 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.81 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 149 aa  176  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.5 
 
 		 184 aa  173  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 		 151 aa  173  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  58.9 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62322  3-dehydroquinate dehydratase 1 (3-dehydroquinase 1) (Type II DHQase 1)  54.86 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  62.96 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 		 148 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 161 aa  166  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  58.57 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  61.48 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  56.76 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0445  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>