34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0086 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0538  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  316  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0044295  normal  0.27748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0086  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  316  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0568  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  316  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  94.3 
 
 
158 aa  296  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  91.03 
 
 
159 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  91.03 
 
 
159 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  89.1 
 
 
219 aa  273  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1126  hypothetical protein  75.47 
 
 
265 aa  224  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2542  hypothetical protein  74.21 
 
 
159 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.651296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3241  hypothetical protein  74.21 
 
 
159 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3536  hypothetical protein  74.21 
 
 
159 aa  223  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3542  hypothetical protein  74.21 
 
 
159 aa  223  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3516  hypothetical protein  74.21 
 
 
159 aa  223  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1322  hypothetical protein  74.21 
 
 
159 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0463  hypothetical protein  74.21 
 
 
159 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  68.15 
 
 
184 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  68.15 
 
 
161 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  73.38 
 
 
180 aa  201  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  32.84 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2716  protein of unknown function DUF721  40.25 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2836  hypothetical protein  39.22 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215531  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3081  hypothetical protein  41.29 
 
 
173 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.082442  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2971  hypothetical protein  35.95 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3120  hypothetical protein  34.21 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432727  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  32 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  32 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3419  protein of unknown function DUF721  34.56 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2746  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156245  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0130  hypothetical protein  33.63 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.56481  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  36.76 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0189  hypothetical protein  30.48 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0156086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>