More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0041 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0048  porin  98.13 
 
 		 375 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0029  outer membrane protein (porin)-like protein  99.73 
 
 		 375 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3214  outer membrane protein (porin)-like  93.56 
 
 		 701 aa  848    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84124  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0030  outer membrane protein (porin)-like protein  94.31 
 
 		 409 aa  783    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0021  outer membrane protein (porin)-like protein  94.31 
 
 		 409 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0031  outer membrane protein (porin)-like protein  90.45 
 
 		 377 aa  709    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0041  outer membrane protein (porin)-like  100 
 
 		 435 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0256  outer membrane porin, putative  80.53 
 
 		 406 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0044  putative porin  80.53 
 
 		 386 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2703  putative outer membrane porin  80.53 
 
 		 386 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3278  putative outer membrane porin  80.53 
 
 		 386 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0044  putative porin  80.53 
 
 		 386 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1849  putative outer membrane porin  80.53 
 
 		 386 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2675  outer membrane porin, putative  80.27 
 
 		 375 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0040  porin  80 
 
 		 375 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4041  porin Gram-negative type  67.73 
 
 		 374 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3390  porin signal peptide protein  52.33 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3279  porin Gram-negative type  52.96 
 
 		 375 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3601  porin Gram-negative type  52.39 
 
 		 375 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.939014 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  29.95 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  29.02 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  30.66 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  29.82 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  31.3 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  31.3 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  31.3 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  31.3 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  32.53 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  29.19 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  30.87 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  30.87 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  30.87 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  31.05 
 
 		 379 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  31.26 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.38 
 
 		 379 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  30.69 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  31.05 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  32.54 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  29.76 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.95 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  30.69 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  31.05 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  32.06 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  32.06 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.13 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  31.09 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  32.06 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  32.06 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  27.62 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  32.06 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  32.06 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  30.99 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  31.58 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  30.99 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  29.38 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  28.95 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  28.95 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  30.02 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  28.95 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  30.49 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  30.28 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.51 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  31.2 
 
 		 373 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.63 
 
 		 363 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  30.41 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  30.41 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  30.99 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  30.93 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  30.93 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  30.93 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  30.93 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  29.67 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  30.93 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  30.24 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  30.93 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  30.93 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  30.79 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.21 
 
 		 352 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  31.02 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  29.78 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  30.31 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  30.13 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  29.33 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  26.61 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  29.19 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  29.19 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  29.19 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  33.91 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  29.81 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  29.06 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  29.06 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  30.34 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  29.26 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  29.95 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.37 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  29.53 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  29.23 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  34.63 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  31.02 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  34.63 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>