284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0035 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
260 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
260 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
260 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  93.08 
 
 
260 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  92.69 
 
 
260 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  92.69 
 
 
260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  89.23 
 
 
260 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  80.62 
 
 
260 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  80.62 
 
 
260 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  80 
 
 
260 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  80.23 
 
 
260 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  80.23 
 
 
260 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  79.84 
 
 
260 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  80.23 
 
 
260 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  80.23 
 
 
260 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  66.92 
 
 
260 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  68.46 
 
 
260 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  66.54 
 
 
260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  52.73 
 
 
261 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  49.61 
 
 
261 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  53.08 
 
 
264 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  53.85 
 
 
262 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  48.4 
 
 
260 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  47.27 
 
 
265 aa  221  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  45.31 
 
 
261 aa  221  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  45.53 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  44.05 
 
 
260 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  44.53 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  42.75 
 
 
261 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  43.8 
 
 
260 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  43.8 
 
 
260 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  48 
 
 
264 aa  204  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  45.93 
 
 
264 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  45.93 
 
 
264 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  45.93 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  45.93 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  45.93 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  42.8 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  40.55 
 
 
262 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  40.55 
 
 
262 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  44.14 
 
 
261 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  43.17 
 
 
256 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  43.1 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  45.29 
 
 
266 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  41.84 
 
 
247 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  42.97 
 
 
260 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  39.37 
 
 
262 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  45.53 
 
 
261 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  45.53 
 
 
261 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  43.75 
 
 
261 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  43.75 
 
 
261 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  45.53 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  45.12 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  41.47 
 
 
260 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  40.86 
 
 
256 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  41.28 
 
 
256 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  41.7 
 
 
240 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  39.76 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  38.79 
 
 
265 aa  168  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  38.79 
 
 
265 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  40.09 
 
 
265 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  36.11 
 
 
258 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  38.79 
 
 
265 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  40.93 
 
 
253 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  38.89 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  35.83 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  38.26 
 
 
261 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
265 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  38.81 
 
 
260 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
265 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
265 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  37.61 
 
 
265 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  40.61 
 
 
258 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  35.25 
 
 
267 aa  158  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  37.4 
 
 
253 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  37.71 
 
 
266 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  37.39 
 
 
258 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  34.84 
 
 
267 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  34.93 
 
 
265 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  40.87 
 
 
258 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  40.97 
 
 
258 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  38.1 
 
 
262 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 
258 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  32.42 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  34.78 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  36.24 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  33.6 
 
 
261 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  35.81 
 
 
258 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  36.59 
 
 
261 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  36.12 
 
 
258 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  35.37 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  33.64 
 
 
260 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 
260 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  34.98 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  33.88 
 
 
264 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  35.45 
 
 
236 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  29.64 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.64 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>