More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0008 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  84.96 
 
 		 757 aa  1152    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  95.41 
 
 		 780 aa  1366    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  84.96 
 
 		 757 aa  1152    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  48.99 
 
 		 807 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  85.5 
 
 		 750 aa  1146    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  84.96 
 
 		 757 aa  1152    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  91.81 
 
 		 781 aa  1334    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  84.96 
 
 		 757 aa  1152    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  71.68 
 
 		 717 aa  973    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  85.03 
 
 		 744 aa  1134    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  85.09 
 
 		 757 aa  1154    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  49.6 
 
 		 803 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  79.81 
 
 		 814 aa  1096    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  48.59 
 
 		 783 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  100 
 
 		 774 aa  1539    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  93.57 
 
 		 777 aa  1359    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  89.26 
 
 		 775 aa  1263    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 774 aa  1539    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  85.23 
 
 		 757 aa  1156    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  78.9 
 
 		 791 aa  1071    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  91.97 
 
 		 771 aa  1303    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  77.35 
 
 		 787 aa  1049    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  50 
 
 		 805 aa  635  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  49.65 
 
 		 804 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  47.19 
 
 		 728 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  44.31 
 
 		 781 aa  535  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  44.17 
 
 		 781 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  43.16 
 
 		 787 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  45.35 
 
 		 736 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  44.22 
 
 		 747 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  44.89 
 
 		 753 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  41.52 
 
 		 738 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  44.08 
 
 		 783 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  42.38 
 
 		 789 aa  505  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  42.66 
 
 		 740 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  41.06 
 
 		 803 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  41.34 
 
 		 803 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  41.8 
 
 		 793 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  32.15 
 
 		 673 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  50.6 
 
 		 810 aa  320  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  35.67 
 
 		 682 aa  320  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  48.21 
 
 		 702 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  31.63 
 
 		 750 aa  306  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  30.28 
 
 		 703 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  31.07 
 
 		 791 aa  288  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  31.44 
 
 		 791 aa  287  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  30.3 
 
 		 662 aa  287  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  33.18 
 
 		 776 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  32.27 
 
 		 748 aa  285  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  31.86 
 
 		 710 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  31.14 
 
 		 650 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  31.64 
 
 		 707 aa  278  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  33.28 
 
 		 758 aa  277  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  46.51 
 
 		 774 aa  274  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  30.87 
 
 		 658 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.88 
 
 		 641 aa  265  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  32.18 
 
 		 645 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  30.72 
 
 		 632 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  30.36 
 
 		 655 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  30.03 
 
 		 670 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  29.06 
 
 		 892 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.29 
 
 		 636 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  33.95 
 
 		 686 aa  234  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  33.95 
 
 		 686 aa  234  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  33.95 
 
 		 686 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  33.95 
 
 		 686 aa  233  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  33.61 
 
 		 686 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  29.34 
 
 		 780 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  29.78 
 
 		 904 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  33.59 
 
 		 654 aa  218  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  33.53 
 
 		 654 aa  217  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  33.53 
 
 		 650 aa  216  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  29.41 
 
 		 897 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  29.43 
 
 		 696 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  30.35 
 
 		 751 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  41.46 
 
 		 634 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  38.12 
 
 		 689 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  39.04 
 
 		 681 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  39.58 
 
 		 716 aa  207  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  35.5 
 
 		 697 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  29.37 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  28.82 
 
 		 773 aa  206  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  38.78 
 
 		 649 aa  205  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  41.51 
 
 		 650 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  40.94 
 
 		 658 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  29.04 
 
 		 706 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  28.94 
 
 		 705 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  28.67 
 
 		 714 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  28.77 
 
 		 705 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  29.06 
 
 		 700 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  29.06 
 
 		 700 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  31.6 
 
 		 703 aa  201  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  37.11 
 
 		 658 aa  201  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  35.39 
 
 		 675 aa  200  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  29.49 
 
 		 842 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  45.15 
 
 		 748 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  38.94 
 
 		 724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  29.23 
 
 		 702 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  32.85 
 
 		 703 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  37.68 
 
 		 705 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>