More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6916 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  85.57 
 
 		 409 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  99.76 
 
 		 409 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  85.33 
 
 		 409 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  99.76 
 
 		 409 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 414 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  43.01 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  37.24 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 397 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.74 
 
 		 421 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.46 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  27.22 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.94 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.94 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  33.54 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  20.27 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  30.69 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  34.48 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  20.99 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  23.53 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  24.85 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 473 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25 
 
 		 474 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  35.71 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 536 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.47 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  26.62 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  26.62 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  26.62 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  26.62 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.92 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.28 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 850 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.39 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  22.39 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 495 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 584 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  28.2 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.39 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 438 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>