28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6901 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  80 
 
 
95 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  54.74 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  52.75 
 
 
96 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  50 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  43.33 
 
 
615 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  48.15 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  43.01 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  43.01 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  43.01 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  41.49 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  41.49 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  40.43 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  38.95 
 
 
191 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  39.58 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  39.36 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  39.36 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  39.36 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  39.76 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  36.56 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  35.23 
 
 
193 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2633  hypothetical protein  33.01 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  33.75 
 
 
203 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  38.46 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  39.36 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  34.69 
 
 
193 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  37.08 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  35.35 
 
 
178 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>