More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6861 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 187 aa  270  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  71.2 
 
 		 187 aa  267  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  71.2 
 
 		 187 aa  267  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 187 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 187 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  52.69 
 
 		 196 aa  168  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  51.18 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  41.77 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 600 aa  95.5  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  32.3 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  32.3 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
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NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
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NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  27.27 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  26.86 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  27.94 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  23.86 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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