93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6854 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  81.72 
 
 
186 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  76.88 
 
 
184 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  76.88 
 
 
184 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  76.88 
 
 
184 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  74.73 
 
 
184 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  74.73 
 
 
184 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  74.19 
 
 
184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  58.89 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  58.89 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  46.11 
 
 
187 aa  167  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  42.22 
 
 
190 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  39.77 
 
 
206 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  29.83 
 
 
179 aa  99  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  34.36 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  34.07 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.74 
 
 
170 aa  95.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  34.25 
 
 
189 aa  94.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  36.08 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  34.62 
 
 
199 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  34.52 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  27.17 
 
 
181 aa  88.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  37.29 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  37.3 
 
 
190 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  38.81 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  33.1 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  33.33 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  44.12 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  36.29 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  26.59 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  43.33 
 
 
148 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  30.3 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  38.14 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  30.99 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  37.82 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  33.09 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  36.59 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  31.45 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  33.1 
 
 
144 aa  72  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  37.17 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  24.43 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  32.5 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  31.85 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.2 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  35.77 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  33.06 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  33.06 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  32.14 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  34.02 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  28.26 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  33.33 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  26.97 
 
 
147 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  32.41 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  30.36 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  30.36 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  25.9 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  27.66 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  29 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  30.6 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  28.57 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  30.84 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  30.84 
 
 
169 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  29.85 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  27.97 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  29.85 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  35 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  26.92 
 
 
200 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  30.23 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  33.67 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  35.29 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  25.93 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  25.93 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  25.93 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  33.82 
 
 
74 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  36.25 
 
 
137 aa  44.7  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  34.33 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  30.53 
 
 
134 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  33.82 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  36.84 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  33.82 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  28.57 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  51.35 
 
 
405 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  28.09 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  38.24 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  42 
 
 
127 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  27.12 
 
 
142 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  38.3 
 
 
410 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  33.73 
 
 
167 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  38.3 
 
 
410 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  28.75 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>