More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6752 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  95.99 
 
 
475 aa  902  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  100 
 
 
475 aa  939  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  78.98 
 
 
489 aa  722  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  100 
 
 
475 aa  939  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  79.19 
 
 
489 aa  722  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  79.19 
 
 
489 aa  724  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  79.19 
 
 
489 aa  724  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  98.74 
 
 
475 aa  930  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  56.16 
 
 
499 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  53.78 
 
 
514 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  53.13 
 
 
496 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  54.51 
 
 
493 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  29.44 
 
 
454 aa  225  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  31.97 
 
 
478 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  29.87 
 
 
477 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  29.87 
 
 
477 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  32.62 
 
 
482 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  30.34 
 
 
487 aa  176  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
478 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  30.04 
 
 
507 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  31.56 
 
 
484 aa  166  7e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.01 
 
 
476 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  29.65 
 
 
470 aa  157  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  2.39079e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  28.82 
 
 
471 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
483 aa  150  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  30.2 
 
 
446 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  28.34 
 
 
480 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  29.55 
 
 
457 aa  141  2e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.71 
 
 
480 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  29.1 
 
 
445 aa  135  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  29.08 
 
 
464 aa  133  7e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
423 aa  131  2e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
460 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27.82 
 
 
443 aa  129  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27.82 
 
 
443 aa  129  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.65 
 
 
452 aa  129  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27.82 
 
 
443 aa  129  2e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27.82 
 
 
443 aa  129  2e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27.82 
 
 
443 aa  129  2e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27.82 
 
 
443 aa  129  2e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  27.82 
 
 
443 aa  129  2e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
443 aa  129  2e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
445 aa  127  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
445 aa  126  8e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
445 aa  126  8e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  31.14 
 
 
445 aa  126  8e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  31.14 
 
 
445 aa  126  8e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  31.14 
 
 
445 aa  126  8e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 
469 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.65 
 
 
438 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
477 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.79 
 
 
463 aa  124  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  1.99551e-15 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  31.14 
 
 
445 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.63 
 
 
468 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.63 
 
 
468 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.63 
 
 
468 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
451 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.63 
 
 
468 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.14 
 
 
468 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  28.86 
 
 
453 aa  118  2e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.14 
 
 
457 aa  117  4e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.65 
 
 
457 aa  116  7e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
465 aa  116  9e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  29.61 
 
 
465 aa  116  9e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  28.57 
 
 
452 aa  115  2e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  28.57 
 
 
452 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.57 
 
 
452 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  28 
 
 
442 aa  114  4e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  28.5 
 
 
442 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.24 
 
 
449 aa  113  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.82 
 
 
471 aa  113  8e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.85 
 
 
474 aa  112  1e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
474 aa  112  1e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.57 
 
 
476 aa  112  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
461 aa  112  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.11 
 
 
499 aa  112  1e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  27.37 
 
 
480 aa  111  2e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.21 
 
 
427 aa  112  2e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
460 aa  111  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  31.51 
 
 
460 aa  112  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  24.46 
 
 
459 aa  111  2e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  27.3 
 
 
441 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
451 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.18 
 
 
485 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.41 
 
 
485 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.79 
 
 
447 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.99 
 
 
487 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  27.01 
 
 
492 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  26.92 
 
 
458 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  25.49 
 
 
447 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  1.4456e-12 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  28.87 
 
 
443 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
404 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.81 
 
 
469 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.33 
 
 
485 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
456 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.25 
 
 
473 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
451 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
433 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.87 
 
 
474 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.87 
 
 
474 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>