More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6720 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  64.57 
 
 
476 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
495 aa  1004    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  982    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.66 
 
 
475 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.03 
 
 
475 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  62.74 
 
 
475 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
482 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.46 
 
 
476 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  54.51 
 
 
476 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  55.27 
 
 
477 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  56.49 
 
 
487 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  55.27 
 
 
477 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  53.14 
 
 
481 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  54.66 
 
 
477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  55.49 
 
 
477 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  53.42 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
478 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  52.84 
 
 
476 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  52.84 
 
 
477 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  52.31 
 
 
478 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  52.2 
 
 
477 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
477 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  48.85 
 
 
480 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.31 
 
 
505 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
481 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.21 
 
 
481 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.21 
 
 
481 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
482 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
478 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  50.1 
 
 
481 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.21 
 
 
481 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.1 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.9 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.42 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.64 
 
 
478 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.63 
 
 
479 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
479 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  47.9 
 
 
477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
480 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  47.43 
 
 
493 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
478 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
485 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  49.58 
 
 
478 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  47.46 
 
 
477 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
478 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
477 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  46.96 
 
 
477 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  49.79 
 
 
478 aa  428  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
496 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.02 
 
 
476 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  44.02 
 
 
476 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
485 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
483 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
483 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40 
 
 
483 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
493 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
484 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
481 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.79 
 
 
483 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.79 
 
 
483 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
478 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.57 
 
 
483 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.57 
 
 
483 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.36 
 
 
483 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.57 
 
 
483 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.51 
 
 
489 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
480 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
500 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.36 
 
 
483 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.15 
 
 
483 aa  358  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  40.69 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
488 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.4 
 
 
480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.91 
 
 
482 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.04 
 
 
482 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.04 
 
 
482 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.7 
 
 
482 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  39.7 
 
 
482 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.7 
 
 
482 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.04 
 
 
482 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.91 
 
 
482 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  39.7 
 
 
482 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.7 
 
 
482 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.83 
 
 
482 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
487 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
500 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
482 aa  352  8e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.76 
 
 
480 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.69 
 
 
484 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  41.74 
 
 
483 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
489 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.14 
 
 
509 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
484 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0768  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
492 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823565  normal  0.0769343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>