More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6630 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 345 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.51 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  41.84 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  42.55 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  37.71 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 308 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.23 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.71 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.54 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 432 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0702  transcriptional regulator, LysR family  32.35 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 308 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 311 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1583  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.86 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.66 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  33.99 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4508  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  0.61755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3909  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>