More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6617 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 318 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 318 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  97.8 
 
 		 316 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  64.09 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  53.33 
 
 		 315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  32.12 
 
 		 314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  32.45 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  28.8 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  32.34 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  30.26 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  31.68 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  30.62 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  31.36 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  28.43 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  28.82 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  30.26 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  25.96 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  24.5 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  25.32 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  31.7 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  25.64 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  29.84 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  29.33 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  26.58 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.24 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  31.8 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  29.47 
 
 		 383 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  31.1 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.79 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.3 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  26.16 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  30.29 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  27.45 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  24.84 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  26.76 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  28.16 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  25.24 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  27.61 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  25.99 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  25.24 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  27.61 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  27.61 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  27.61 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  26.64 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  29.56 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  27.61 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  28.73 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  24.01 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  25.95 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  26.4 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  28.25 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  27.84 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  25.25 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  29.32 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  33.46 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  27.88 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>