92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6614 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  219  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  219  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  96.84 
 
 
95 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  57.47 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  47.67 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  38.1 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  42.5 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  43.59 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.05 
 
 
429 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  43.66 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  43.59 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.66 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
429 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
429 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  51.67 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  36.59 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.59 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  36.59 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.86 
 
 
452 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.59 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  38.96 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  40.54 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.37 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.33 
 
 
478 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  36.59 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  46.55 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  45 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  42.86 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  31.07 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  37.66 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  39.13 
 
 
469 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  40.79 
 
 
78 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  41.25 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  40.51 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
983 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  42.67 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  40.51 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  42.47 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  35.16 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  41.89 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
960 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  38.96 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  38.96 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  36.59 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  37.04 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  32.22 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  33.33 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  38.46 
 
 
99 aa  47.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  49.12 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.65 
 
 
963 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
984 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
591 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  34.62 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  32.93 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  39.47 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5072  ferredoxin  38.96 
 
 
85 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  37.66 
 
 
114 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  34.67 
 
 
128 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  36.99 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  34.67 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
452 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30 
 
 
988 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  35.06 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  36.36 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  34.67 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  38.33 
 
 
937 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  32.91 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  36.14 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  34.18 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  37.74 
 
 
961 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.29 
 
 
976 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  30 
 
 
96 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.14 
 
 
989 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  35.82 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.62 
 
 
989 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.14 
 
 
989 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  37.33 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.77 
 
 
976 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  39.34 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  37.33 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.82 
 
 
984 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.44 
 
 
945 aa  40  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  38.78 
 
 
98 aa  40  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.14 
 
 
995 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  32.81 
 
 
980 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 
955 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>