More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6361 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  100 
 
 
342 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
355 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  76.9 
 
 
343 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  97.26 
 
 
342 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  40.35 
 
 
374 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  40.6 
 
 
475 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 
470 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 
475 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 
375 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  43.84 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  41.95 
 
 
460 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  41.95 
 
 
460 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  43 
 
 
372 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 
349 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 
366 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.99 
 
 
351 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  39.2 
 
 
368 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  39.3 
 
 
393 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 
366 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  41.19 
 
 
380 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  43.38 
 
 
363 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
351 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 
366 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  42.05 
 
 
375 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.45 
 
 
375 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  43.38 
 
 
363 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 
352 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  41.75 
 
 
352 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  41.75 
 
 
352 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 
351 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 
401 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43.38 
 
 
364 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43.38 
 
 
364 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  38.78 
 
 
368 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.05 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  41.42 
 
 
352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  44.86 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 
366 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  40.96 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  44.26 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 
359 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.57 
 
 
355 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  41.85 
 
 
364 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 
411 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  35.34 
 
 
410 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 
404 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  39.51 
 
 
351 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 
364 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.95 
 
 
344 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  33.96 
 
 
334 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 
369 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 
406 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 
375 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  36.93 
 
 
363 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  39.18 
 
 
342 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40.85 
 
 
348 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 
380 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 
374 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  37.65 
 
 
332 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 
390 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  38.14 
 
 
373 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  41.86 
 
 
373 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41.53 
 
 
372 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  38.24 
 
 
395 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  37.23 
 
 
413 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  38.24 
 
 
395 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.78 
 
 
355 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  34.69 
 
 
347 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  38.24 
 
 
395 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.33 
 
 
347 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  38.24 
 
 
395 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  38.24 
 
 
395 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  42.95 
 
 
352 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  38.24 
 
 
395 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  38.24 
 
 
395 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.4 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 
352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.63 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  40.94 
 
 
373 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 
377 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.13 
 
 
387 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  43.09 
 
 
354 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 
383 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 
365 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.6 
 
 
351 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  35.1 
 
 
380 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 
397 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 
387 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  40.79 
 
 
378 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  35.52 
 
 
360 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.45 
 
 
349 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  41.42 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>