More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6323 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
345 aa  691  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
345 aa  691  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  97.97 
 
 
345 aa  680  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  58.67 
 
 
346 aa  438  1e-122  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  58.06 
 
 
341 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  59.09 
 
 
331 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  48.95 
 
 
334 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  28.35 
 
 
336 aa  145  7e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  31.82 
 
 
331 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  33.45 
 
 
336 aa  141  1e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  30.72 
 
 
325 aa  141  2e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  33.19 
 
 
320 aa  141  2e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  30.86 
 
 
335 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 
324 aa  140  4e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
334 aa  139  5e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
334 aa  139  8e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 
332 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  2.78765e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.11 
 
 
325 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 
334 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 
322 aa  137  3e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 
326 aa  136  6e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  30.3 
 
 
331 aa  136  6e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
323 aa  135  1e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 
332 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  28.78 
 
 
334 aa  132  1e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.09 
 
 
327 aa  132  1e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
320 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 
285 aa  130  4e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  28.61 
 
 
347 aa  130  4e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  24.77 
 
 
326 aa  130  4e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  28.61 
 
 
347 aa  129  5e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  28.61 
 
 
347 aa  130  5e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.58985e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 
336 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  35.23 
 
 
347 aa  129  7e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  32.23 
 
 
340 aa  129  8e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  26.32 
 
 
321 aa  129  9e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
338 aa  128  1e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 
330 aa  129  1e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  29.27 
 
 
314 aa  128  2e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  35.43 
 
 
337 aa  127  2e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  30.49 
 
 
330 aa  128  2e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
306 aa  128  2e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 
324 aa  127  2e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  9.34033e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 
330 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 
332 aa  126  4e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 
321 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 
330 aa  125  8e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
337 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 
333 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  24.92 
 
 
324 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
326 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6714e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 
337 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
335 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 
326 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
320 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
319 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
320 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
342 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 
342 aa  123  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  35.6 
 
 
354 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 
299 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
341 aa  122  1e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 
335 aa  122  1e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
320 aa  121  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 
344 aa  121  2e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 
317 aa  121  2e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.03 
 
 
327 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 
334 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
324 aa  120  4e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 
360 aa  119  8e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  28.61 
 
 
361 aa  118  1e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  24.85 
 
 
329 aa  118  1e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.83 
 
 
323 aa  118  2e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
343 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 
331 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  33.47 
 
 
324 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 
328 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  31.08 
 
 
331 aa  115  8e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  33.88 
 
 
320 aa  115  8e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  33.88 
 
 
320 aa  115  8e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
335 aa  115  9e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 
356 aa  115  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  34.18 
 
 
324 aa  115  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  30.99 
 
 
316 aa  115  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 
328 aa  114  2e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 
348 aa  114  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  30.98 
 
 
321 aa  114  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.27 
 
 
326 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
348 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  28.57 
 
 
333 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 
327 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 
351 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 
319 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 
326 aa  113  4e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  28.66 
 
 
345 aa  113  4e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  32.27 
 
 
347 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  33.47 
 
 
324 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 
372 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 
323 aa  112  8e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  33.78 
 
 
324 aa  112  8e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  5.80095e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>