35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6280 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  100 
 
 		 161 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  100 
 
 		 161 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  98.76 
 
 		 161 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  88.82 
 
 		 161 aa  265  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  63.23 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  53.08 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  50 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  51.05 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  51.37 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  48.84 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  44.19 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  46.41 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  44.03 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  46.15 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  43.61 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  45.97 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  41.26 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  39.74 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  36.5 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  35.4 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  38.69 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  34.27 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  36.91 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  34.85 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  35.21 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  33.57 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  35.33 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  34.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  26 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  34.27 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3125  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  32.52 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0194025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  29.29 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  26.9 
 
 		 284 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>